Предпринимаемые Россией действия вызывали сопротивление местного населения. Они всеми способами противились русской колонизации. В разных частях возникали вооружённые столкновения между колонистами и коренными жителями, на землях которых переселенцы строили свои поселения, остроги и заводы, распахивали пастбища, вырубали и жгли леса.
Одним из таких народов были башкиры или, как они сами себя называли, Башкурты. Они яростно сопротивлялись русской экспансии, сжигали и разрушали жилища и имущество переселенцев. Но это не могло остановить вторжение в их вотчинные58 земли вопреки договорённостям, заключённым в 16 веке между башкирами и Российским государством во времена царствования Ивана Грозного. Царское правительство гарантировало мирную жизнь, совместное отражение вражеских агрессий, соблюдение вотчинного права башкир, свободу вероисповедания, невмешательство во внутренние дела и сохранение местного самоуправлении. В итоге права башкир были грубо нарушены. Правительство игнорировало просьбы коренных жителей остановить вторжение в их земли, используя при этом все средства для того, чтобы добиться желаемого. В ход шли подкупы, угрозы, интриги, жестокость и казни. Для достижения цели были хороши любые средства. Умело использовались и разобщённость башкирских родов, и безмерное стремление башкирской знати к богатству, их постоянная междоусобная, взаимная неприязнь, откровенная вражда и борьба за власть. Все попытки башкир создать собственное государство наталкивались на непреодолимые разногласия и различие подходов к решению этого вопроса. На ханство в Башкирии было несколько претендентов, но ни один из них так и не сумел доказать законность притязаний на ханский престол.
Нескончаемая борьба между родами неоднократно приводила к тому, что земли башкир подвергались разрушительным набегам соседних с ними народов. Так же и башкирские племена были не слишком щепетильными по отношению к своим соседям и при каждой возможности наносили ответный удар. Набеги давали