О количестве жертв опричного террора Ивана Грозного судят по лично составленным царём синодикам, куда он вносил имена казнённых для поминания на церковных службах (каялся Иван Грозный всё-таки перед Господом за их казни!) Эти синодики насчитывают около 4000 имён. Полагая, что туда были внесены не все «жертвы внесудебных репрессий», особенно слуги, гибнувшие вместе со своими господами, историк Б. Б. Веселовский считал, что общее количество казнённых при Иване Грозного достигало примерно 10—15 тысяч человек.
Опричный террор стал составной частью внутренней политики царя. Он сопровождался массовым уничтожением целых боярских, княжеских родов. Казни и ссылки происходили регулярно. Погибли тысячи знатных и незнатных жителей Москвы и других русских городов. Кульминацией опричного террора стали погромы в Новгороде, Твери, Торжке в 1569—1570 годах. Царь воспользовался ложным доносом о том, что новгородцы хотят изменить ему и перейти к Литве. На расправу было направлено опричное войско. По дороге оно учинило погромы в Твери и Торжке, где погибло много жителей. Наиболее жестокой была расправа с новгородцами. Погром продолжался больше месяца. По данным историков, погибло от 10 до 15 тыс. человек.
Опричнина формально закончилась в 1572 году, когда царь ее «отставил». Недовольство царя опричниками проявилось еще в 1570 году, когда по его приказу в Москве было публично казнено более ста видных опричников. В числе опричников были не только люди типа Малюты Скуратова и Федора Басманова, но и представители самых знатных фамилий – Бельские, Басмановы, Вельяминовы, Воронцовы, Милославские, Одоевские, Панины, Шуйские и другие. В опричнину были приняты и Романовы – родственники будущего основателя новой царской династии Михаила Романова. Опричником был и Б. Ф. Годунов, будущий российский царь. Фактически опричная политика, проводимая менее жесткими методами, продолжалась до конца жизни Ивана Грозного.
Последствия опричнины были жестокими. Княжеская аристократия была разгромлена и унижена, старые удельные вотчины перешли к царю. Даже верное дворянство превратилось в «холопов самодержавия». Произошло общее разорение государства. Центральные районы, особенно московские земли, опустели. Вместе с изгнанными из них боярами ушли их холопы, а также множество свободных