Вообще, попытки давних и недавних исследований разделить новгородцев в их отношении к Москве и Литве по социальному принципу (аристократия – за Литву, а черные люди – за великого московского князя) не увенчались успехом. Устремления разных слоев населения Новгорода сохранить свободу и независимость своего родного города-государства причудливо переплетались с теми социальными конфликтами, которые разворачивались в нем. Немалую роль пока играли и религиозные противоречия: в Великом княжестве Литовском в это время усиливались позиции католичества.
Верность православию заставила новгородцев в 1470 г. призвать сына киевского князя Михаила Олельковича, известного своей верностью религии отцов и дедов. Но тут, после смерти архиепископа развернулась борьба вокруг выборов нового. Ставленник Борецких при этом потерпел поражение и Михаил, также связанный с Борецкими, вынужден был уйти из Новгорода.
И все-таки именно Марфе удалось вновь поднять «черных» людей на борьбу. «Худые мужики» на вече проклинали Москву и призывали к союзу с Казимиром. Был составлен проект договора с великим князем литовским. Однако реальной помощи новгородцам он не оказал.
Иван III двинул войска, и на р. Шелони в июле 1471 г. новгородцы потерпели поражение. Битва наглядно выявила те противоречия, которые назрели в новгородском обществе. Отборный архиепископский полк не двинулся с места. Москвичи перебили 12 тыс. новгородцев, 2 тысячи увели в плен. Посадник Дмитрий Борецкий и трое бояр были обезглавлены.
Потом был поход 1475 г., основной целью которого было уничтожение новгородского суда и замена его великокняжеским. В конце 1477 г. был совершен еще один поход: Новгород капитулировал, вечевой колокол – символ древнего славянского народовластия был снят и увезен в Москву. Вместе с Новгородом к Москве отошли огромные территории, простиравшиеся до Студеного (Белого) моря и до Камня (Урала), т. е. богатый русский Север.
Огромный земельный фонд Новгорода был использован Москвой для создания поместной системы. Значительную роль в разработке норм поместного права сыграла валовая опись новгородских земель, которая началась по приказу великого князя в 1495 г. После присоединения Новгорода дни вольности Твери, со всех сторон окруженной московскими владениями, были сочтены. В сентябре 1485 г., когда московские войска подошли к Твери, тверской князь Михаил бежал в Литву. На тверской стол московский князь посадил своего сына Ивана Ивановича. При Василии