Постепенно с развитием торгово-экономических связей к началу XIX века между казахским и русским населением приграничных регионов начали устанавливаться добрососедские отношения. Прежние взаимные набеги пошли на убыль. На пограничных ярмарках активизировалась торговля. Среди казахов и русских получило широкое распространение тамырство (побратимство).
К двадцатым годам ХIХ столетия институт ханства потерял характер высшего органа власти, способного управлять внутренними делами жузов. Царская администрация ликвидировала ханство и стала проводить по своей инициативе реорганизацию управления с целью превращения этого края в колонию Российской империи. Между тем единых подходов к организации управления Оренбургским и Западносибирским регионами не было.
Так, по мысли М. М. Сперанского, в 1822 г. был издан «Устав о сибирских киргизах», который начал воплощаться в жизнь только для населения Среднего жуза и небольшой части Старшего жуза, отошедших в ведомство Западносибирского генерал-губернатора. Ханская власть в Средней орде была уничтожена, и все внутреннее управление было передано непосредственно казахским общинам. Основными единицами управления были волости, управляемые своими султанами. Волости были сгруппированы в два округа: Каркарлинский и Кокчектаевский. Во главе их поставлены приказы, состоявшие из выбранных главных султанов, трех русских заседателей и двух казахских. Внутри самой степи были обустроены казачьи поселения. Право вершить правосудие и устанавливать наказание было оставлено за биями, то есть почетными судьями среди казахов. Как правило, бии не назначались, а избирались самим народом, считавшим их авторитетными, справедливыми, честными и грамотными ораторами.
Новое устройство коснулось и части оренбургских казахов Младшего жуза в 1824 г., что обусловило упразднение ханства. Степь была разделена на три части, управление которыми осуществляли старшие султаны. Этим султанам была дана неограниченная власть, к каждому из них был прикомандирован отряд из казаков. Российская гражданская власть сосредотачивалась в оренбургской пограничной комиссии над оренбургскими казахами. В территориальном отношении новая система, продиктованная российским правительством, совершенно игнорировала прежнее родовое деление земель, что вызывало недовольство казахов.
На этом расширение российских границ в степи не закончилось. В период между 1824 и 1838 гг. российские передовые военные посты достигли Алатау и Актау вплоть до границы с Голодной степью