В тот же день 3 июля на заседании Малой Рады Симон Петлюра огласил свой первый приказ в качестве законного военного министра о немедленной отправке на фронт украинизированного полка имени Богдана Хмельницкого (2600 штыков). Но полк отказался идти на фронт, а солдаты заявили, что желают «защищать революцию – охранять Центральную Раду». Такое поведение единственного украинского полка ставило под сомнение саму идею украинизировать армию.
Этим кризисом стремилась воспользоваться группа Михновского, подняв на бессмысленный бунт второй украинский полк имени гетмана Полуботка (4600 штыков), который также не желал выезжать на фронт, заявляя о своей «миссии» – охране «воли Украины».
С помощью солдат из полков имени Хмельницкого и Полуботка группа Михновского надеялась захватить Киев. В ночь на 5 июля солдаты-«полуботковцы» покинули казармы и устремились в центр города с неясными целями, при этом рассчитывая «изменить ход истории». Мятежники захватили почту, телеграф, интендантские склады, штаб милиции. Но что делать дальше, они не знали… Солдатам обещали, что к восстанию присоединятся украинские части Киева и Центральная Рада. Но даже бойцы полка имени Хмельницкого не поддержали бунтарей и атаковали «полуботковцев», заставив их вернуться в казармы и сложить оружие. Петлюра провел переговоры с представителями бунтарей, в ходе которых солдаты согласились немедленно отправиться на фронт.
Во время визита Симона в Ставку Верховного главнокомандующего последний пообещал больше не противиться украинизации. Петлюра издал приказ, согласно которому в украинизированных полках русские офицеры заменялись офицерами украинского происхождения. 19 июля Верховным главнокомандующим был подписан приказ об украинизации 9 дивизий, проект создания 1-го и 2-го украинских корпусов. Тогда бытовало мнение, что украинизация частей может привести к росту их боеспособности и отвлечет солдат-украинцев от большевистской пропаганды.
26 июля произошла провокация, связанная с обстрелом неизвестными солдат полка имени Хмельницкого, в ходе которого погибло 16 солдат. После этого главком Корнилов решает приостановить украинизацию войск. Грушевский писал, что в эти дни украинские социалисты ожидали «какой-то неожиданной катастрофы: арестов, вооруженного нападения или чего-то подобного. Мы постоянно чувствовали глаза контрразведки». 4 августа Временное правительство издало «Временную инструкцию Генеральному секретариату», по которой Украинский Генеральный секретариат подпадал под руководство Временного правительства. «Инструкция» фактически ликвидировала должность Петлюры, и он остался без министерского портфеля.
В конце августа 1917 года Россию потряс мятеж главкома Лавра Корнилова. Петлюра, как руководитель Генерального военного комитета, выступил