Жители деревни Койкары, узнав от детворы о прибытии отряда, организовали из лодок наплавной мост. Как только красноармейцы переправились по нему через реку, над деревней появился английский самолет.
Тетя Алеши Афанасьева, полоскавшая белье на реке, закричала детям, чтобы они бежали скорее по домам. Сама же, схватив мальчика на руки, кинулась в их избу, чтобы укрыться в подполе. Вдруг дом затрясся от оглушительного взрыва, стекла со звоном полетели из окон. Фекла Петровна с трехлетним мальчиком рухнула на пол, сраженная осколком бомбы.
«Вставай, вставай, тетя!» – кричал и плакал Алеша, пока не потерял сознание. Так его впервые посчитали убитым, обнаружив всего в крови и почти бездыханного на груди раненой женщины.
После окончания в 1927 году начальной школы в родной деревне Алексей два года работал в своем хозяйстве, помогая отцу с матерью. Семья постоянно испытывала нужду, хотя и трудилась от зари до зари то на лесозаготовках, то в поле. В 1931 году Афанасьевы вступили в колхоз, и Алексей смог продолжить учебу в Мунозерской ШКМ (школе колхозной молодежи), расположенной в селе Спасская Губа. После ее окончания, в 1933 году, он поступил на медицинский рабфак в Петрозаводске.
Алексей с раннего детства хорошо ходил на лыжах и имел неплохую физическую подготовку. Когда подрос, спорт стал его любимым занятием. На втором курсе рабфака Афанасьева включили в состав команды рабфака для участия в городских лыжных соревнованиях студенческой молодежи, где он занял второе место. Позднее по комсомольской путевке закончил в Петрозаводске курсы по подготовке преподавателей физкультуры для семилетних и средних школ.
Трудовую деятельность А. Афанасьев начал в 1936 году инструктором физкультуры «Сунастроя». В 1937–1939 годах работал в «Сунасплавстрое»: десятником на участке и регулировщиком на шпалорезке.
В сентябре 1939 года Алексей Афанасьев был призван в ряды Красной армии Кондопожским райвоенкоматом Карельской АССР. В январе – марте 1940 года в должности пулеметчика взвода разведки лыжного батальона принимал участие в боях на Карельском перешейке во время Советско-финляндской войны 1939–1940 годов. На лыжах, с пулеметом на спине, в составе разведгрупп он несколько раз проникал за линию фронта с целью сбора информации о местоположении частей противника.
Однажды перед отделением под командованием старшего сержанта Тимофеева была поставлена задача узнать расположение финских частей за Выборгом, в районе Юустила. Разведчики, среди которых находился и Алексей Афанасьев, скрытно перейдя линию фронта, на лыжах углубились в лес в направлении намеченного квадрата поиска. Обосновавшись на небольшой высотке, они несколько дней вели наблюдение за частями противника. Только когда была выяснена вся система вражеской обороны, разведгруппа двинулась в обратный путь.
Неожиданно в пути они натолкнулись на вражескую землянку. Подобравшись к дымоходу, Алексей Афанасьев и Михаил Карпов стали подслушивать. Из указаний находившегося внутри финского командира