Нельзя не сказать и о взглядах Л.И. Мечникова на методологию геополитических исследований. Прежде всего, он подчеркивает значение аналитического метода, который позволяет изучать сначала влияние отдельных условий данного пространства, а затем влияние физико-географической среды во всей совокупности и разнообразии различных условий.
Л.И. Мечников выделил три основные сферы влияния:
• астрономические влияния (преимущественно географической природы и климата);
• влияние физической среды (взаимовлияния геосферы, гидросферы, атмосферы);
• влияние растительного и животного мира и антропологических условий (как человек приспосабливает среду к своим потребностям).
Мечников предупреждал, что применение аналитического географического метода способно привести к ошибкам и увлечениям в политических выводах: поверхностный анализ способствует созданию многочисленных телеологических фантазий и ошибочных дедуктивных обобщений. Например, политики привыкли смотреть на высокие горные цепи как естественные границы между государствами, расами и культурами. Тем не менее, этот взгляд не верен. Так, Альпы, составляющие политическую границу между Францией, Италией и Германией, являются в то же время местом смешения трех главных европейских рас – латинской, галльской и германской. Сложный этнологический состав населения Кавказа и Гималайских гор должен быть неопровержимым доказательством того, что самые высокие и неприступные горные цепи вопреки общераспространенному мнению играют роль убежищ, где происходит сближение самых разных этнических элементов под влиянием суровых условий жизни.
После анализа следует антропологический синтез, под которым Мечников понимал выявление влияния антропологической среды на политическую историю разных народов. Пример такого синтеза политической истории он хотел осуществить в своей книге. Ее цель Мечников видел в выявлении скрытой внутренней связи между различными историческими фазами в судьбе цивилизованных народов и той географической средой, в которой эти народы жили и развивались. Замыслу Мечников не суждено было осуществиться в полной мере. Завершенной оказалась только первая часть его работы, в которой он исследовал первый исторический период в развитии цивилизаций: