С 1994 года до последних лет жизни А.Х. Касымжанов возглавлял кафедру философии и методологии социального познания факультета философии и политологии КазГУ.
Благодаря его наставничеству более 70-и аспирантов, соискателей, докторантов защитили соответственно кандидатские и докторские диссертации. Среди его учеников ведущие философы Казахстана. Практически нет ни одного учебного заведения нашей страны, где бы ни работали его ученики и воспитанники. Он организовывал и проводил летние школы молодых философов, научные конференции различного уровня, руководил деятельностью специализированных советов. А.Х. Касымжанов сотрудничал с учеными крупнейших философских центров России и Чехословакии, Узбекистана и Грузии, Кыргызстана и Украины, Таджикистана и Армении. Творческие контакты связывали его с такими известными учеными современности, как Бонифатий Михайлович Кедров, Бободжан Гафурович Гафуров, Эвальд Васильевич Ильенков, Артур Владимирович Сагадеев. Он участвовал в проектах Фонда Эберта в Казахстане, Иранского культурного Центра.
В ноябре 2000 года ушел из жизни яркий ученый, мыслитель А.Х. Касымжанов, однако научные традиции в КазНУ имени аль-Фараби, связанные с фарабиеведением нашли достойное продолжение.
В память о выдающемся ученом, мыслителе, наставнике А.Х. Касымжанове кафедра философии с октября 2003 года ежегодно проводит международную конференцию «Касымжановские чтения», приуроченную ко дню рождения А.Х. Касымжанова.
Этот проект, задуманный его учениками и последователями, нашел самую активную поддержку в деканате факультета философии и политологии, в ректорате КазНУ имени аль-Фараби, среди представителей научной и педагогической общественности г. Алматы и всей республики. Непосредственно актуальным проблемам фарабиеведения была посвящена конференция «Третьи Касымжановские чтения – «Аль-Фараби в истории культуры» (2006 г.).
Каждая из граней личности А.Х. Касымжанова – будь то фундаментальные исследования философских проблем, педагогическая деятельность или общественно-политическая позиция – свидетельствуют о ее масштабности. А.Х. Касымжанов всегда был на переднем крае науки, остро чувствуя наше сложное, неоднозначное время на стыке двух тысячелетий. Его научные традиции живы в КазНУ имени аль-Фараби и по сей день.
МҰРАҒАТ ҚҰЖАТТАРЫ