Помимо собора, в грандиозный архитектурный комплекс Ватикана входят различные культовые, дворцовые и крепостные сооружения, представляющие огромную архитектурно-художественную ценность. Этот торжественный ансамбль формировался на протяжении нескольких столетий, с XIII до XIX в., начиная с момента, когда папы вновь вернулись в Рим после «авиньонского пленения» (1309–1377). Сегодня комплекс не представляет собою однородного архитектурного целого; это – собрание дворцов, залов, галерей и капелл, принадлежащих к разным эпохам и заключающих в себе бесценное собрание сокровищ архитектуры, живописи и скульптуры. Весь ансамбль выглядит в плане как неправильный четырехугольник, протянувшийся с юга на север от храма Св. Петра. Продольные восточный и западный фасады образованы двумя галереями, соединяющими старый Апостольский дворец с Бельведером. Пространство между этими галереями разделено двумя поперечными корпусами – Библиотекой и Браччио Нуово – на три внутренних дворика. Во всем комплексе зданий насчитывается до 20 дворов, более 200 лестниц и 12 000 комнат.
Апостольский дворец – обширный (55 тысяч кв. м) комплекс построек разных эпох со множеством залов, галерей, апартаментов, внутренних двориков, соединенных переходами, формирующих весьма внушительный ансамбль. Его внешний облик характеризуется чрезвычайной простотой, почти полным отсутствием архитектурного декора, зато интерьеры поражают своим великолепием. Комплекс дворца включает в себя такие жемчужины, как Королевская лестница (XVII в., Л. Бернини), парадный Королевский зал (XVI в., А. да Сангалло-младший), капеллы Паолина (XVI в., арх. А. да Сангалло-старший) и Никколина (XV в., с фресками Беато Анджелико), апартаменты Борджа, дворик Сан-Дамасо с лоджиями Рафаэля. В залах дворца и в Сикстинской капелле находятся всемирно прославленные росписи Рафаэля и Микеланджело – величайшие шедевры Высокого Возрождения.
В ансамбль Апостольского дворца входит несколько капелл. Капелла Паолина получила свое название по имени папы Павла III – по его поручению она была построена в 1540 г. Антонио да Сангалло-младшим. От Сикстинской капеллы ее отделяет только Королевский зал. В 1550 г. великий Микеланджело выполнил для Паолинской капеллы две фрески: «Обращение св. Павла» и «Мученичество св. Петра». Другие росписи капеллы выполнены Лоренцо Саббатини и Федерико Дзуккаро.
Лоджия, расположенная в восточной части двора Св. Дамаса, носит название лоджии Рафаэля. Ее начал возводить в 1506 г. знаменитый зодчий Браманте, старший друг и земляк Рафаэля, ибо тоже был родом из Урбино. Семидесятилетний Браманте скончался (в 1514 г.) в разгар своей работы над реконструкцией Ватикана. Так что двор Сан-Дамасо с ныне знаменитыми лоджиями заканчивал уже Рафаэль. Он и руководил их росписью, выполненной в 1517–1519 гг. его учениками Джулио Романо, Джованни да Удине и др.
Лоджии Рафаэля – это длинная галерея,