Граф Раймонд Тулузский, очевидно, признав своё поражение, 13 января 1099 года выступил в поход на Иерусалим. В феврале к нему примкнули другие вожди крестоносцев. 15 июля 1099 года рыцари взяли Иерусалим.
Бодуэн сам не отправился в Иерусалим, отрядив часть своего отряда во главе с племянником Танкредом. А сам 1 марта вернулся в Антиохию. Теперь никто не мешал ему утвердить свою власть в городе.
Теперь Бодуэну необходимо было узаконить свои монаршие права и получить официальный титул, который никто не смог оспорить.
В Италии он именовался довольно просто: «Бодуэн сын герцога Роберта Гвискара». Таким же титулом он пользовался в Антиохии ещё в 1098 году, когда подписал хартию для генуэзцев.
Решив принять монарший титул, Бодуэн сталл действовать так же, как и его отец, признавший себя вассалом «Святого престола». В 1100 году Бодуэн получил титул владетельного князя от папского легата архиепископа Даимберта Пизанского, прибывшего летом 1099 года в Сирию с флотом в 100 кораблей.
Князь Бодуэн Тарантский стал планомерно расширять свои владения, в основном за счёт византийцев. Заключив союз с папским легатом епископом Даимбертом Пизанским, он обрушился на византийскую Латакию.
Его агрессии помешали другие вожди крестоносцев. Возвращаясь из Иерусалима, граф Тулузский со своими рыцарями разбили лагерь близ Латакии в Джабале. Под угрозой военного конфликта с крестоносцами Антиохийский князь вынужден был снять осаду.
Потерпев неудачу в Латакии, Бодуэн решил взять реванш в византийском Мараше.
В июле 1101 года князь Бодуэн и Рожер Салернский напали на Мараш. Но им пришлось снять осаду, поскольку рыцарей позвал на помощь армянский князь Гавриил, правитель Милитены. С 300 рыцарей Бодуэн поспешил на помощь, но попал в засаду и был пленён эмиром Каппадокии Гази ибн Данишмендом. Князя отправили в Неокесарию (Никсар) на Чёрном море.
Антиохийские бароны Робер де Сурдеваль, Рено де Мазуар, Робер Флорентийский, коннетабли Ричард и Адам, дука Антиохии Рауль Арский избрали регентом Танкреда. Граф Эдессы Бодуэн Булонский поставил во главе гарнизона Антиохии Бодуэна Ретельского.
Но в 1101 году в государственном управлении франкских государств на Востоке произошли коренные изменения. Умер первый Иерусалимский монарх Годфруа Булонский и бароны предложили престол его брату графу Эдессы. Бодуэн Булонский отправившись в Иерусалим, передав Эдессу своему родственнику Бодуэну де Ретелю. Антиохия оказалась под полным контролем Танкреда.
Князь Бодуэн Тарантский заложил основу для образования независимого государства в Сирии – княжества Антиохии. В действительности князь Бодуэн действительно много сделал для завоевания Антиохии. Гораздо больше, чем все остальные крестоносцы. Ещё до начала и во время осады города Бодуэн разгромил мусульманские войска, прибывавшие на помощь к осаждённым из Мосула, Дамаска и Алеппо.