При приближении крестоносцев местное население греки и армяне поднимали восстания против турок-сельджуков. Благодаря поддержке населения Танкред, племянник князя Бодуэна, с небольшим отрядом в 100 рыцарей и 200 оруженосцев за несколько недель прошёл всю Киликию, захватив порт Александретту и замок Баграс.
В октябре 1097 года крестоносцы подошли к Антиохии. 20 октября Бодуэн первым разбил свой лагерь у северных ворот Святого Павла. Позднее к городу подошли другие отряды крестоносцев. Началась осада.
В декабре 1097 года в лагере крестоносцев испытывавших острую нехватку продовольствия, начался голод. Рыцари ослабли. Этим обстоятельством тут же решили воспользоваться осаждённые. 1 января они произвели массированную вылазку. Атаку мусульман едва удалось отбить.
Во время Антиохийской осады произошёл, спровоцированный князем Бодуэном Тарантским, фактический разрыв крестоносцев с Византией. В феврале 1098 года, в виду острой нехватки продовольствия, протопроедр Татикий увёл византийский отряд от Антиохии на Кипр. Перед оставлением лагеря крестоносцев Татикий передал Бодуэну в управление города Тарс, Адану, Мамистру, как гарантию скорого возвращения византийской армии. При этом Бодуэн сам упрашивал Татикия отвести войска от Антиохии.
Уход византийцев был преподнесён князем Бодуэном, как предательство. Его поддержал племянник Танкред, давний враг Византии. Они же возглавили антивизантийскую партию.
Сторонники союза с императором папский легат Адемар Монтейльский (умер 1.08.1098) и граф Тулузы, отправили в Константинополь посольство, во главе с графом Гуго де Вермандуа и графом Бодуэном де Эно. Однако император Алексей I Комнин не решился продолжать поход в Сирию, предпочитая, довольствоваться уже достигнутыми успехами, и укрепиться в Малой Азии.
Не достигнув соглашения, граф Вермандуа вернулся во Францию, а граф Эно погиб в стычке с турками. Это развязало руки князю Бодуэну, получившему обоснования, чтобы не передавать Антиохию императору. Он начал настоящую травлю Византии, отказавшись от дальнейшего похода на Иерусалим. И ещё до падения Антиохии предъявил свои права на город.
3 июня 1098 года франки вступили в Антиохию, лишь незначительная часть мусульманского гарнизона смогла укрыться в цитадели. Но уже 5 июня к Антиохии подошли мусульманские войска, и крестоносцы сами оказались в окружении. Однако крестоносцам удалось разгромить мусульман. 28 июня сдались остатки гарнизона, укрывшегося в цитадели. Весь город оказался под властью рыцарей. Над Антиохией стал развиваться пурпурный флаг Бодуэна Тарантского.
Захват Антиохии вовсе не означал установления там личной власти Бодуэна. На город