Новгородская республика всегда обладала особым статусом по сравнению с другими русскими землями. За долгое время здесь сформировался класс богатейших боярских родов, который не желал подчиняться никакой внешней власти, в том числе и московской, начав открытую борьбу с великими князьями. Для этого новгородское боярство начало искать союзников в лице литовских князей, но у них не было никаких шансов в этом противостоянии. Ивану III удалось покорить неприступный Новгород. Война с Новгородом продолжалась все 70-е гг. XV в. пока в 1478 г. он полностью не капитулировал. В 80-е гг. Иван III, конфисковав земли новгородских бояр в казну, переселил их в Москву или другие города княжества, одарив их поместьями.
Следующим этапом укрепления власти великого князя становиться подавление борьбы внутри государева двора, многие представители которого могли претендовать на великокняжеский престол. Первым ее эпизодом можно считать ликвидацию уделов, принадлежащих ближайшим родственникам великого князя, начатую Иваном III и продолженную его преемниками Василием III и Иваном Грозным. А продолжением укрепления власти уже царской в противостоянии с аристократией, является уже ранее рассмотренная опричнина Ивана IV.
Однако, попытки решения вопроса ограничения влияния на царя со стороны крупнейших боярских родов не удалось и Ивану Грозному. В стране необходимо было существование ближнего круга, на который опирался царь, возводивший на освободившиеся места боярской аристократии преданных ему представителей менее знатных фамилий. Они же брали в свои руки всю полноту власти после сильного правителя, преемник которого уже не имел необходимых способностей для управления страной. Преемником Ивана IV становится его сын Федор, главную роль в государстве стали играть бывшие опричники, выдвинувшиеся при царе Иване.
Смута, разыгравшаяся после его смерти, во многом была вызвана расшатыванием внутренней ситуации в стране борьбой за власть среди правящего класса, сформировавшегося при Грозном. Подобная ситуация сложилась после ухода из жизни Петра I, когда управлять государством стали люди, выдвинувшиеся при первом русском императоре. Борьба за власть во времена Смутного времени в начале XVII в. привела к частой смене правителей на царском престоле, пока не был найден компромиссный вариант в лице Михаила Романова.
Признание власти в России новой династии, как среди боярской