С 1918 г. в Средней Азии, и прежде всего в Узбекистане, сформировалось и год от года усиливалось движение, названное басмачеством (басмак, тюрк. – совершать налет). В басмачестве объединились три группы людей: 1) простаки, не разобравшиеся в целях и формах действий, решений представителей новой советской власти, а главное – резко осудившие антимусульманскую направленность, непочитание правил и традиций ислама со стороны советской власти; 2) порочные личности – воры и жулики, – решившие в условиях политических беспорядков разжиться, грабя других, но непременно тех, кто слабее их; 3) представители вооруженного националистического движения феодально-байских (баи – крупные землевладельцы или скотоводы, а также ростовщики) элементов, мусульманского духовенства, поддерживаемые иностранными империалистами и реакционными кругами Турции, Китая, Афганистана, имевших цель недопущения установления советской власти в Средней Азии. Басмачество стало хорошо вооруженным движением, непримиримым врагом советской власти. Но басмачество, точнее его основные силы, был разгромлен Красной Армией при поддержке ее частью местного населения в 1922 г., басмаческие отряды были фактически окончательно ликвидированы в 1933 г.
В апреле 1918 г. была образована Туркестанская Автономная Советская Социалистическая республика, существовавшая в составе РСФСР почти до конца октября 1924 г. Ее столицей был Ташкент.
Установление, укрепление советской власти в разных частях Узбекистана было совсем не мирным. Особенно в первые годы слабой тогда советской власти в разных городах и селениях Узбекистана вспыхивало недовольство против нее. Например, Ташкентский мятеж произошел в январе 1919 г. с целью свержения советской власти в Туркестане, во главе его стоял бывший прапорщик царской армии К.П. Осипов. Мятеж был подготовлен Временным комитетом (который состоял из семи организаций и групп) и английской военно-дипломатической миссией в Ташкенте. Во время мятежа расстреляли 14 туркестанских комиссаров и других советских и партийных работников. Мятеж был ликвидирован, подавлен войсками Красной Армии.
В ходе национального размежевания на территории Туркестанской автономной советской социалистической республики образовались в 1924 г. советские социалистические республики: Узбекская ССР и Туркменская ССР, а также Таджикская автономная советская социалистическая республика, Кара-Киргизская и Каракалпакская