Население национальных окраин Российской империи, в том числе и население Туркестана, в меньшей мере страдало от рекрутской повинности, чем остальные российские подданные. В рекруты и на длительный срок забирали главным образом православных подданных: русских, украинцев, белорусов. Кроме того, представители неправославных народов, прежде всего городские купцы и мещане, пребывали в более выгодных экономических и юридических условиях, обладая определенной хозяйственной самостоятельностью и некоторыми личными правами. Но царское правительство изыскивало возможности ущемлять интересы среднеазиатского населения, что вызывало увеличение недовольства царем и царским правительством. Неудивительно, что в 1916 г. произошло Среднеазиатское восстание (см. текст далее).
Иногда кое-что в мирных интересах своих среднеазиатских подданных неспешно творили незначительные, но добрые дела русские цари. В 1868 г. при императоре Александре II, во время землетрясения в Ташкенте сильно разрушилась мечеть Джами (XV в.), в оставшиеся 13 лет его царствования мечеть так и не восстановили; только на седьмом году царствования нового императора Александра III, в 1888 г. эту мечеть восстановили (после ее 20-летнего пребывания в полуразрушенном виде) на средства, пожертвованные лично Александром III, который уважал религиозные чувства и потребности всех своих подданных, в том числе и мусульман. В 1903 г. император Николай II подарил ташкентскому женскому Свято-Троицкому монастырю участок земли в 524 га в 25 км от Ташкента. Когда в 1912 г. заканчивали строительство нового дворца Нуруллабая, то Николай II подарил Хиве для этого дворца хрустальные люстры. Николай II первым из русских царей при последних бухарских амирах Абдуллахаде (правил в 1885–1910 гг.) и Алим-хане (правил в 1919–1920 гг.) намечал свой визит в Туркменистан и прежде всего – в Ташкент, но революционные беспорядки в Центральной России не позволили ему покинуть Петербург и приехать в Среднюю Азию.
Присоединение Туркестана (Туркестанского края) к Российской империи способствовало расширению изучения природы, природно-ресурсного потенциала этих мест. К середине XIX в. мало было известно о наличии полезных ископаемых на узбекских землях. Природные богатства оставались слабо исследованными