Императрица стала законодательницей моды в Европе. Во-первых, худощавая Евгения ввела моду на женскую стройность, и модницы усердно старались похудеть. Во-вторых, при дворе Евгении работал первый в истории моды кутюрье – Чарльз Ворт. Императрица шила наряды только у него, и со временем наряды от Чарльза стали необыкновенно популярными и очень дорогими.
Евгения любила отдыхать на океанском побережье. Муж построил для нее в Биаррице грандиозную виллу «Евгения», позже переименованную в Отель-дю-Пале. Сотни женщин оценили эту идею и с удовольствием подхватили ее, начав уезжать летом отдыхать на море.
Каждую зиму Евгения и Наполеон III катались на коньках по озеру в Булонском лесу, привлекая толпы парижан. Танцы на коньках мгновенно стали модным развлечением.
В 1865 г. в Париже вспыхнула эпидемия холеры. В охваченном паникой городе назревал бунт. Монаршая чета, отдыхавшая в Биаррице, срочно вернулась в столицу. Наполеон ввел карантин, а Евгения лично посетила все холерные бараки и, оставив свиту снаружи, поздоровалась за руку и пожелала выздоровления каждому больному. Как это ни удивительно, но народ успокоился, и эпидемия прекратилась. Когда через год вспышка холеры повторилась в Амьене, Евгения отправилась туда и вновь общалась с больными.
Королеве были не чужды проблемы народа: она основывала приюты и детские дома, строила новые больницы, поддержала исследование Луи Пастера, который изобрел вакцину против бешенства.
В 1870 г. разразилась франко-прусская война. Поводом к ней стала борьба за испанский престол. Евгения запретила мужу идти на компромиссы с Пруссией в вопросах, касавшихся ее родины, поэтому многие считают ее виновной в произошедшем. Наполеон отправился на войну, его армию разгромили, а император попал в плен. Евгения смогла прорваться к мужу, и именно тогда они осознали связывавшие их узы близости и взаимопонимания. Однако семейное счастье Евгении было недолгим. После подписания мира императорская семья покинула Францию и перебралась в Англию. В 1873 г. после неудачной операции по дроблению камней в почках Луи-Наполеон умер. В 1879 г. их сын принц Лулу с английскими войсками отправился в Южную Африку и погиб в стычке с зулусами. Безутешная Евгения похоронила мужа и сына в аббатстве Святого Михаила в Англии и приготовила рядом место для себя. После этого она прожила еще 41 год.
Последние годы жизни бывшая императрица проводила в Англии, Испании и на Лазурном берегу. Евгения Бонапарт скончалась 11 июля 1920 г. в возрасте 94 лет. Согласно ее личному распоряжению,