Тип почвы Nahuinpuquio (Dystric Cambisol) распространены на крутых поверхностях на большой высоте (13 % площади), к востоку от р. Сьютоканха (Suitocancha). Профиль почв маломощный, коричневого цвета, суглинистый. Органического вещества мало, почвы очень кислые, с крайне низким содержанием питательных веществ. Почва умеренно подходит для естественных пастбищ, не подходит для пахотных земель и лесного хозяйства.
Фермерами в области Куилкас почвы классифицируются на основании взаимосвязанных критериев: цвета, текстуры, расположение по высоте, пригодности под культуры[12]. Классификации почв учёными и фермерами различаются, поскольку применяются разные подходы к выделению почвенных разностей. Фермеры подразделяют почвы по признакам, а при научном подходе применяется принцип диагностики состава и свойств почв.
В результате обследования и классификации почв установлено[21], что в области Куилкас нет почв, полностью пригодных для выращивания культурных растений. Всего 10 % площади может быть использовано в качестве пахотных земель и при этом они относятся к категории почв с низким или средним плодородием; 14 % изученной территории могут быть использованы под пастбища, которые обладают средне-низкой продуктивностью; 24 % – пригодны для лесных угодий. Большая часть – 52 % почв территории – не должна использоваться в сельском хозяйстве. Такие рекомендации, ограничивающие сельскохозяйственное производство, определяются климатическими факторами (засуха или низкие температуры), плодородием почв и рельефом (крутые склоны, опасность эрозии почв или её развитие). Большинство выделенных типов почв имеет два или все три ограничения по этим параметрам. Некоторые из них быть сняты с помощью мелиоративных мероприятий (орошения, борьбы с эрозией) или агрохимических (внесение удобрений).
Почвенный покров формируют многочисленные типы почв, которые различаются как учёными, так и фермерами. Однако знания фермеров о почвах касаются только тех свойств, которые определяют плодородие. Основными факторами, ограничивающими производство сельскохозяйственной продукции, является засуха в период вегетации растений в сочетании с низким естественным плодородием почв. Росту продуктивности почв препятствует невозможность использования органических удобрений (навоза) из-за их отсутствия и высокая рыночная стоимость минеральных удобрений. Дополняет все негативные условия деградация почв в результате водной эрозии.
Улучшение условий производства растениеводческой продукции возможно при повышении плодородия почв с использованием комплексного подхода к эксплуатации экосистем. Сюда входят мероприятия по сохранению и накоплению органического вещества в почвах, улучшение водного режима, применение удобрений. Для достижения этих целей важны исследования для более эффективного использования существующих ирригационных систем в районе Сан-Маркос. Для района Куилкас целесообразно