Созданная в административном порядке система специализированных банков вскоре показала свою неэффективность. Монополия одного банка сменилась монополией нескольких ведомственных банков. Инструментами денежно-кредитной политики по-прежнему оставались административно утверждаемые кассовый и кредитный планы.
Не создавались предпосылки для формирования финансовой инфраструктуры: денежного рынка, рынка капиталов, ценных бумаг, валютного рынка. Сохранилось принудительное прикрепление к банкам корпоративной клиентуры. Возросло управленческое звено банковской системы на уровне области, края и автономной республики.
Поскольку реорганизация проводилась в пределах имевшейся штатной численности учреждений Госбанка, возник острый дефицит кадров на уровне отделений, которые и без того были перегружены работой. Скорость прохождения платежных документов значительно замедлились. Резко возросли остатки невыясненных сумм, существенно увеличилось время обработки данных и составления сводного баланса как по каждому из специализированных банков, так и по банковской системе в целом. Как вспоминают ветераны банковской службы «сводить платежные документы было очень трудно, а не исполнить – невозможно». В здание Промстройбанка СССР на Тверском бульваре приезжали разгребать завалы из коробок с документами целые бригады работников областного звена со всех союзных республик.
Работа специализированных банков стала приходить в противоречие с нарождающимися рыночными отношениями, чему в значительной степени способствовала меняющаяся ситуация в стране, ибо партия и правительство провозгласило право предприятий самостоятельно решать все хозяйственные вопросы. Происходило массовое образование кооперативов, чаще всего путем выделения на самостоятельный баланс структурных подразделений крупных государственных предприятий и строительных организаций. Перестройка экономики сопровождалась ликвидацией системы материально-технического снабжения, что привело к созданию обширной сети посреднических и торговых предприятий (одних только товарно-сырьевых бирж к 1991 году насчитывалось более 500).
В качестве позитивных результатов банковской реформы 1988 года можно назвать прекращение кредитования убытков и сверхплановых запасов товарно-материальных ценностей, а также выдачи предприятиям и колхозам кредитов на восполнение утраченных оборотных средств. Изъятия излишних безналичных денежных средств (платежных и кредитных) из хозяйственного оборота было приостановлено, а собственные оборотные средства предприятий и колхозов увеличились до 30–50 % от потребности. Высвободившиеся краткосрочные кредитные ресурсы в размере свыше 75 млрд. руб. были направлены на финансирование неотложных государственных нужд.
После XIX партконференции (июнь 1988 г.) в партийно-хозяйственной элите страны начинает