войне и в честь 10-летия РККА А. Н. Черников был награжден орденом Красного Знамени (1928). После войны в июне 1922 г. 63-я бригада, куда входил 187-й стрелковый полк, была сведена в полк, а А. Н. Черников назначен командиром 87-го стрелкового полка. В сентябре командирован на учебу в Военную академию РККА. В мае 1925 г. досрочно окончил ее и был направлен в заграничную командировку в Китай, занимал должность военного советника пулеметных курсов в армии Фынь-Юй-Сяна, с 1926 г. – советника дивизии, 6-го корпуса и Правобережной армии у Цзян-Кай-Ши (Чан Кайши). Участвовал в Тяньцзинской, Сычуанской, Наньганской, Нанкинской операциях. По возвращении в СССР А. Н. Черников был назначен начальником курса старшего комсостава курсов «Выстрел». С августа 1929 г. и. д. начальника отдела боевой подготовки штаба ОКДВА, в составе полевого штаба армии принимал участие в боях на КВЖД. С 30 апреля 1931 г. начальник и военком Омской пехотной школы. С декабря 1933 по июль 1934 г. вновь учился в Военной академии РККА им. М. В. Фрунзе, затем служил в Управлении по командному и начальствующему составу РККА при НКО СССР в должностях начальника отдела и пом. начальника управления. В мае 1936 г. назначен начальником 6-го отдела Генштаба РККА. В апреле 1937 г. отстранен от должности и зачислен в распоряжение Управления по командному и начальствующему составу РККА. В августе 1937 г. назначен старшим преподавателем в Военную академию РККА им. М. В. Фрунзе. С апреля 1939 г. и. д. пом. командующего войсками ХВО по вузам. В феврале 1939 г. комбриг А. Н. Черников был награжден орденом Красной Звезды. С октября 1939 по июль 1940 г. командовал 10-й армией, участвовал с ней в походе Красной армии в Зап. Белоруссию. С июля по ноябрь 1940 г. состоял в распоряжении НКО, затем был назначен зам. командующего войсками ХВО. В начале Великой Отечественной войны в той же должности. В декабре 1941 г. генерал-майор А. Н. Черников был назначен командиром 206-й стрелковой дивизии, находившейся на формировании в Юж.-УрВО в г. Бугуруслан. В конце апреля 1942 г. она входила в 3-ю резервную армию в ПриВО. В начале июля дивизия по ж. д. была передислоцирована в район Воронежа, где с 10 июля вошла в состав 40-й армии Воронежского фронта и вступила в тяжелые оборонительные бои по обороне города. Уже 16 июля А. Н. Черников был контужен и госпитализирован, по излечении в конце сентября направлен в распоряжение Военного совета Донского фронта. С 10 октября вступил в командование 49-й стрелковой дивизией, которая в составе 66-й армии Донского фронта вела бои с противником, прорвавшимся к Волге севернее Сталинграда. С 8 ноября 1942 г. дивизия была подчинена 24-й армии и в ее составе участвовала в контрнаступлении советских войск под Сталинградом. Дивизия вела наступательные бои по овладению выс. 43,8, однако поставленная задача не была выполнена. Приказом по армии от 22.11.1942 «за слабое руководство частями дивизии, за неорганизованность в проведении атаки, за срыв атаки по причине невывода частей на указанный рубеж для атаки, за отсутствие требовательности к подчиненным при выполнении боевой задачи » он был снят с должности и зачислен в резерв Военного совета Донского фронта.
