Накапливавшееся недовольство было максимально подогрето жесткими мерами греческого правителя, направленными против иудейской религии. В 167 г. до н. э. он издал эдикт, запрещающий населению выполнять предписания яхвизма – соблюдать субботу и предписанные Торой установки в приеме пищи, делать обрезание, приносить жертвоприношения. Иерусалимский храм был превращен в святилище Зевса Олимпийского. Гонения на религию были восприняты местным населением как призыв к сопротивлению. Вооруженные отряды, действовавшие против греков в Иудее и на юге территории бывшего Израиля, были возглавлены священником Маттати из рода Хасмонеев, которого восставшие провозгласили своим вождем.
Тактика восстания заключалась в подрыве греческого контроля в провинциях для его последующего ослабления в Иерусалиме, который был отрезан восставшими от военных баз и других центров страны. Это восстание вошло в историю под именем сына Маттати Иуды Маккавея, который вместе со своими братьями возглавлял военные действия с 166 по 160 г. до н. э. Ему удалось одержать несколько внушительных военных побед и даже захватить Иерусалим.
В иудейской истории Иуда Маккавей считается выдающимся полководцем. Фактически восстание Маккавеев дало возможность освободиться от влияния Греции, обеспечив политическое доминирование рода Хасмонеев в Иудее и свободу вероисповедания. Военный успех не всегда сопутствовал повстанцам. Иуда Маккавей пал в бою в 160 г. до н. э., а его братья перешли к тактике партизанской войны. Сопротивление продолжалось до 152 г. до н. э., когда раздоры в династии Селевкидов превратили армию Маккавеев в важный фактор, с которым должен был считаться претендент на престол. По этой причине царь Сирии Александр Балас назначил первосвященником Иудеи Ионатана, брата Иуды Маккавея. Эту должность представители рода Хасмонеев занимали на протяжении 150 лет. Иудея за десятилетие усилилась в военном отношении, расширила свои границы и добилась политической самостоятельности. В 142 г. до н. э. правитель Селевкидского государства был вынужден освободить Иудею от уплаты дани, что означало обретение независимости и завершение 25летней борьбы, начавшейся восстанием против политики Антиоха Эпифана.
Весной 1947 г. в местности Хирбет-Кумран в северо-западной части побережья Мертвого моря произошло сенсационное событие: бедуины из племени таамире в одной из пещер