Вторым серьезным направлением в теории инноваций, помимо рассмотренного выше подхода к циклическому развитию экономики, является изучение различных инновационных систем. Анализ способов, которыми осуществляется деятельность различных субъектов экономики, а также создания инноваций привел к оценке важности учета всевозможных систем и сетей, комбинирующих действия экономических агентов и правительственных организаций. В рамках этого направления исследования идентифицировали диапазон субъектов, вовлеченных в системы инноваций, способы, которыми они объединяются, конкурируют и кооперируют, а также социальное и культурное основание этих взаимодействий [184, с. 32].
Наиболее интенсивно исследования в области инновационных систем начали осуществляться со второй половины 1980-х годов и первой половины 1990-х, что было связано с формированием понятия экономики, основанной на знаниях. Пионерами в этой области были Фримен (Freeman), Б. Линдваль (B. Lundvall), Карлссон (Carlsson), М. Портер (M. Porter), среди российских исследователей можно отметить Н. И. Иванову, О. Г. Голиченко, А. А. Дынкина. Объектами изучения в рамках данного направления являются национальные, региональные, секторные и технологические инновационные системы.
Наиболее существенное аналитическое внимание исследователей уделялось инновационной системе на уровне страны – национальной инновационной системе (НИС). О. Г. Голиченко определяет НИС как «совокупность национальных государственных, частных и общественных организаций и механизмов их взаимодействия, в рамках которых осуществляется деятельность по созданию, хранению и распространению новых знаний и технологий» [25, с. 13]. К настоящему моменту сложились два основных подхода к изучению НИС. Один из подходов может быть определен как «институциональный подход», исследующий отношения между национальными учреждениями финансов, образования, науки и техники, коммерческими организациями (особенно занимающимися исследованиями и разработками), а также государственной политикой. Наиболее заметным представителем этого подхода является Р. Нельсон (R. Nelson). Другой подход, анализирующий