В начале 1452 года Яков приглашает графа Дугласа на переговоры в Стерлинг, выдав предварительно письменные гарантии безопасности. Во время ужина 22 февраля 1452 года, взбешённый отказом Дугласа разорвать союз с Макдональдами, король ударом ножа убивает графа.
Убийство, совершенное в нарушение гарантий безопасности, вызывает возмущение в стране. В Стерлинг с большим отрядом сторонников прибывает брат Уильяма Дугласа Джеймс, новый граф Дуглас. Обвинив короля в вероломстве, он заявляет о разрыве вассальных отношений с королем и сжигает Стерлинг. Одновременно начинаются восстания против королевской власти союзников «Чёрных Дугласов» – Джона Мак-Дональда, лорда Островов, графов Кроуфорда и Морея. Однако восстание развивается в рамках традиционного для феодализма отказа в повиновении сюзерену, – Дуглас не воспользуется возможностью свержения монарха. Яков II тем временем заручается поддержкой парламента Шотландии и организует военную экспедицию во владения Дугласов. В результате, к концу 1452 года король и граф Дуглас договариваются о примирении.
В 1455 году, воспользовавшись тем, что английский покровитель Дугласа герцог Йоркский отстранен от власти Ланкастерами и в Англии начинается «война Алой и Белой Розы», король Яков II возобновляет наступление на дом «Черных Дугласов». Королевские войска вторгаются во владения графа Дугласа, вынудив его бежать в Англию. В битве при Аркингольме армия, набранная сторонниками Дугласа, разбита, граф Морейский убит. Под давлением короля парламент Шотландии в августе 1455 года утверждает обвинение в измене Дугласа и его сторонников и принимает решение о конфискации их владений.
Разгром «Чёрных Дугласов» станет триумфом королевской власти в Шотландии и династии Стюартов. Во многом эта победа становится возможной благодаря личным качествам самого короля Якова II, – выдающегося стратега и полководца, активно использующего самые современные военные средства (например, тяжелую артиллерию), а также тонкого политика, сумевшего уступками и взятками нейтрализовать сторонников Дугласов (в том числе лорда Островов). В Якове II соединяются черты личности Роберта Брюса и Людовика «XI».
Разгром крупной аристократии позволяет королю выстроить новую опору режима, – массовая раздача титулов и земель Яковом II способствует созданию «новой знати» из представителей среднепоместного дворянства, получившего графские титулы, и более тесно связанного с королевской властью (Гордоны, Кэмпбеллы, Синклэры). Яков II также может рассчитывать на поддержку парламента, созыв которого становится регулярным в конце правления короля. Через парламент проведены важные мероприятия, способствующие укреплению государственной власти в Шотландии: ликвидация наследственных должностей, упорядочение