Подавляющая часть объектов редких металлов сосредоточена в южной части Горного Алтая на территории Кош-Агачского района в пределах Южно-Алтайского редкометалльного золото-серебряного района. Здесь выявлено около 20 месторождений и крупных проявлений редких металлов – вольфрама, молибдена, висмута, бериллия, лития, рубидия, цезия, тантала, ртути. Большинство объектов являются комплексными.
Из выявленных вольфрамовых месторождений разрабатывается только Калгутинское. По запасам вольфрама оно относится к разряду мелких месторождений [Алтай, 2005], однако кроме вольфрама (около 2 %) здесь имеется молибден, медь, висмут, бериллий, рубидий, цезий. Содержание в руде золота достигает 0,5 г/т, палладия – 2 г/т, платины – 7 г/т [Кудачин, Чебров, 2000].
Ртутные объекты представлены подготовленным к освоению Чаганузунским месторождением, запасы которого составляют 7 % от балансовых запасов России [Кудачин, Чебров, 2000].
Оруденение скандия и редкоземельных элементов сосредоточено в пределах крупного по запасам Кумирского месторождения на юге Алтайского края. Содержание скандия в рудах колеблется от 50 до 2400 г/т. Предварительно оцененные запасы и прогнозные ресурсы категорий С2– Р2 составляют: руды – 1723,1 тыс. т, скандия – 282,6 т при бортовом содержании 70 г/т, иттрия – 320,1 т, оксида ниобия – 100,2 т, рубидия – 450,7 т, урана – 382,1 т, тория – 160,2 т. Прогнозные ресурсы категории Р3 Кумирского рудного поля составляют 6,6 млн т руды, содержащей 1088 т скандия, 2,5 тыс. т редкоземельных элементов, 4141 т урана [Минерально-сырьевые…, 2007].
Благородные металлы. В пределах приграничной территории известны рудопроявления и месторождения золота и серебра. Основные балансовые запасы рудного золота приграничья сосредоточены в комплексных месторождениях полиметаллических руд Рудного Алтая и составляют по категории В-С1 около 38 т, при содержании от 0,16 до 6,34 г/т [Березиков, 1995]. Из россыпных золотоносных объектов приграничья наиболее перспективны Кумирский золотороссыпный узел с прогнозными ресурсами 1065 кг, в том числе категории Р1 – 665 кг, категории Р2 – 400 кг [Минерально-сырьевые., 2007].
Особое место занимают техногенные месторождения золота, которые оцениваются в связи с хвостами переработки полиметаллических руд месторождений Рудного Алтая. Хвостохранилище Змеиногорской золотообогатительной фабрики характеризуется запасами золота по категории