Карагана гривастая (Caragana jubata (Pallas) Poiret). Статус 2: уязвимый вид, находящийся под угрозой исчезновения. Реликт неогеновых широколиственных лесов. Основной лимитирующий фактор, влияющий на сокращение численности этого вида, – сбор растений на лекарственное сырье.
Остролодочник блестящий (Oxytropis nitans Turcz.). Статус 3: редкий вид, с сокращающимся ареалом. Лимитирующий фактор – хозяйственная деятельность человека.
Мертензия даурская (Mertensia davurica (Pallas ex Smis) G. Don). Статус 3: редкий вид, с сокращающимся ареалом распространения. Лимитирующий фактор – хозяйственная деятельность человека.
Рододендрон Адамса (Rhododendron adomsii Rehd.). Статус 3: редкий вид, с сокращающимся ареалом. Лимитирующий фактор – сбор растений на букеты и для лекарственных целей.
Рододендрон даурский (Rhododendron dauricum L.). Статус 2: уязвимый вид, находящийся под угрозой исчезновения. Лимитирующие факторы – хозяйственное освоение территорий, изменение условий произрастания (пожары, вырубки), а также сбор растений на букеты.
Лилия карликовая (Lilium pumilum Delile). Статус 3: редкий вид, с сокращающимся ареалом. Высокодекоративное и лекарственное растение. Лимитирующий фактор – хозяйственная деятельность человека, сбор на букеты.
Мытник длинноцветковый (Pedicularis longiflora J. Rudolph). Статус 3: редкий вид, с сокращающимся ареалом. В Тункинской котловине численность популяции мала, что, возможно, связано с неадекватными условиями произрастания, не свойственными биологии вида. Однако, в районе оз. Хубсугул популяция этого вида имеет достаточно широкое распространение.
Башмачок капельный (Cypripedium guttatum Sw.). Статус 2: уязвимый вид, находящийся под угрозой исчезновения. Высоко декоративен. Лимитирующий фактор – хозяйственная деятельность человека, сбор на букеты.
Башмачок крупноцветковый (Cypripedium macranthon Sw.). Статус 2: уязвимый вид, находящийся под угрозой исчезновения. Высоко декоративен. Лимитирующий фактор – хозяйственная деятельность человека, сбор цветов на букеты, малочисленность особей в популяции.
Гнездовка камчатская (Niotia comschatea (L.) Reichenb.). Статус 3: редкий вид, с сокращающимся ареалом. Лимитирующий фактор – хозяйственное освоение территорий, изменение условий произрастания (пожары, вырубки, экзогенные геоморфологические процессы).
Родиола розовая (Rhodiola rosea