13 января 1994 г. при избрании спикера нижней палаты коммунисты выдвинули на этот пост своего беспартийного коллегу по фракции В.А. Ковалёва. Далее он снял свою кандидатуру, т. к. коалиционным кандидатом левоцентристов стал член фракции Аграрной партии И. Рыбкин, который и был избран председателем Госдумы.
23 февраля Дума объявила амнистию, по которой вышли на свободу в основном арестованные фигуранты «дела ГКЧП», а также оппозиционные деятели, участвовавшие в событиях 1 мая и 21 сентября – 4 октября 1993 г. Фракция КП РФ поддержала данную инициативу.
23 марта большинство членов фракции КПРФ в Думе не проголосовало за вотум недоверия правительству, но уже 8 июля ситуация была обратной. Правда, предложение не набрало необходимого количества голосов.
21 апреля состоялся пленум ЦИК КП РФ, на котором были осуществлены кадровые изменения. Президиум ЦИК был расширен путём включения в него Лукьянова и Шабанова (он стал заместителем председателя ЦИК). Ставшие руководителями АПР М. Лапшин и И. Рыбкин, соответственно, прекратили быть членами ЦИК.
23—24 апреля партия провела II Всероссийскую конференцию, где приняла решение о вступлении в СКП-КПСС. Оно было подтверждено 9—10 июля, когда Совет СКП-КПСС принял КП РФ.
По инициативе президентских сил весной 1994 г. началась разработка «Договора об общественном согласии»78, церемония подписания которого состоялась 28 апреля. КП РФ, левопатриотические, коммунистические организации, леволиберальное объединение «Яблоко» отвергли документ, который предполагал сотрудничество с Президентом и Правительством, поддержку новой Конституции, обязательство со стороны двухпалатного парламента принять ряд ключевых решений для развития положений Конституции, недопустимость выступлений с требованием о проведении досрочных выборов. Г. Зюганов, М. Лапшин, Г.А. Явлинский, В. Анпилов и др. прибыли на церемонию, где отказались подписать соглашение. Кроме непримиримой оппозиционности, дополнительным основанием для неучастия в таких договорённостях стало убийство 26 апреля депутата Госдумы А.Д. Айздердзиса. По мнению фракции КП РФ, на фоне данного трагического события подписание предложенного договора было неуместным по соображениям морально-этического характера, к тому же коммунисты требовали ответственности со стороны правоохранителей, отставки министра внутренних дел В.Ф. Ерина79.
22 июня 1994 г. коммунисты в Думе проголосовали за бюджет на 1994 г. в третьем чтении.
27 октября коммунисты проголосовали за недоверие кабинету министров после доклада Черномырдина об экономическом состоянии страны, но инициатива не получила требуемых 226 голосов.
10 января 1995 г. из фракции КПРФ в Госдуме был исключён В. Ковалёв, ставший министром юстиции в правительстве Черномырдина.
21—22 января прошёл III съезд КПРФ, который принял изменения в Устав. На смену Центральному исполнительному комитету пришёл Центральный комитет, в который было избрано 139 человек и 25 кандидатов