В 1921 г. военные суды продолжали расправы над коммунистами. Так, в марте был расстрелян коммунист из Вилкавишкиса А.Манелис, в июне – активный коммунист из Купишкиса П.Варкалис. В июне-августе 1921 г. были проведены массовые аресты коммунистов – так в Каунасе в тюрьму заключены Б.Леонас-Пушинис, Й.Кубицкис, П.Шапарас и еще несколько их коллег, прошли аресты коммунистов и в Паневежисе, Укмерге, Шяуляе и других городах Литвы. В 1921 г. суды осудили 123 членов литовской компартии.
С осени 1920 г. деятельность КПЛ в Литве все более налаживалась. 1920–1922 годы – это фактически переходный период к систематической подпольной деятельности КПЛ. Основные фигуры компартии в то время – К.Пожела, Ю.Грейфенбергерис, Й.Кубицкис, И.Гашка, П.Шапира, З.Валайтис, П.Вилунас, Б.Леонас-Пушинис и еще несколько их коллег.
10 октября 1922 г. состоялись выборы в первый Сейм Литвы. В них участвовали и представители компартии. Был создан так называемый список «куопининкай». В Сейм Литвы попали 5 его представителей – К.Доминас, Й.Кубицкис, К.Матулайтис, П.Вилунас и Е.Шабанене. Это очень не понравилось лидерам крупных буржуазных партий. Они всячески мешали членам Сейма коммунистам, а в апреле 1923 г. все они были арестованы. Вместе с ними были арестованы еще свыше 120 человек-активистов «куопининков» – членов компартии, комсомольцев, профсоюзных активистов. Против 92 из них начали уголовное дело о якобы антигосударственной деятельности. Расследование было долгое, и судебный процесс начался только в апреле 1926 г. Процесс закончился в июне 1926 г., все были оправданы.
Политический процесс – «дело куопининку» – вызвал большой резонанс. Последние речи обвиняемых вышли как отдельное издание и были очень популярны среди народа. Вот фрагменты последних речей. Людас Адомаускас: «Наша идея – власть трудового народа в каждой стране. Мы должны выбрать в Сейм тех, кто, несмотря на жестокое преследование, идет вперед с красным флагом. Ведь красный флаг – это символ рабочего движения». Игнас Гашка: «Я участник революции 1918–1919 гг. в Литве. Я горжусь этим. И я открыто говорю – я сторонник советской власти. Что же касается обвинения, то могу сказать, что обвинительный акт глупый и сфальсифицированный. Это подлог, это дело рук фашистской разведки». Пранас Вилунас: «Нас обвиняют, что якобы мы враги Литвы. Это вранье! Мы за Литву! За Литву, которой управляет народная власть. Мы твердо против того, что Литва продается польским империалистам, немецким империалистам!»
С июня 1926 г. в Литве начались постепенные прогрессивные перемены. Это связано с тем, что в выборах Сейма Литвы победили социал-демократы и партия ляудиников, президентом страны выбран довольно умеренный и