В мае 1793 г. участвовал в высадке на о-в Сан-Педро в Сардинии и в осаде Тулона, где получил ранение, в 1794 г. сражался против французов в Каталонии, отличился в сражении 13 августа 1794 г. на высотах Куллеры. Принимал участие в обороне Кадиса от англичан, в октябре 1797 г. награждён чином сержанта.
Участвовал в морских сражениях при Сен-Винсенте и Трафальгаре, где, сражаясь на борту линейного корабля «San-Ildefonso», был ранен и захвачен в плен.
После возвращения на родину оставался без служебного назначения.
2 июня 1808 г. присоединился с чином младшего лейтенанта к пехотному полку Волонтёры Ллерены, 19 июля 1808 г. сражался при Байлене, где обратил на себя внимание генерала Кастаньоса и за мужество был награждён чином лейтенанта.
Направленный в провинцию Эстремадура, Морильо возглавил партизанский отряд и успешно действовал против французов, 18 декабря 1808 г. нанёс поражение неприятельскому кавалерийскому отряду (150 сабель) при Альмараце, 22 декабря 1808 г. отбил нападение французов на Конде, 22 января 1809 г. произведён в капитаны пехотного полка Волонтёры Испании и 18 февраля 1809 г. направлен для ведения партизанской войны в Галисии. Вынудил к капитуляции французский гарнизон Виго, 7—8 июня 1809 г. отличился в сражении при Понтесампайо, в 1811 г. награждён чином бригадира, в 1813 г. соединился с армией герцога Веллингтона, 3 июля 1813 г. – полевой маршал (mariscal de campo), отличился в сражении при Виттории, где был тяжело ранен при штурме оборонительных позиций французов на высотах Пуэбло, произведён в генерал-лейтенанты.
18 февраля 1815 г. по приказу короля Фердинанда VII возглавил военную экспедицию (15 тыс. солдат), направленную для подавления восстания в Южной Америке, 7 апреля 1815 г. высадился на берег в Пуэрто-Санто и 9 апреля совместно с бригадиром Моралесом вынудил к капитуляции 3-тысячный гарнизон Пампатара, затем отвоевал у патриотов Новую Гранаду, захватил Картахену и в 1818 г. нанёс поражение войскам генерала Боливара при Ла Пуэрте. Боролся против инсургентов с чрезвычайной жестокостью, но, не получая опоры метрополии, не смог задушить движения за независимость и 27 ноября 1820 г. подписал с Боливаром акт о перемирии в Санта-Ане де Трухильо.
В декабре 1820 г. возвратился в Испанию, где за заслуги был награждён титулами графа де Картахена и маркиза де ла Пуэрта, 4 мая 1821 г. назначен генерал-капитаном Новой Кастилии, но не сумел ограничить революционные движения и спустя 18 месяцев подал в отставку.
В 1823 г. вместе с сохранившими лояльность испанскими войсками присоединился к французской армии герцога Ангулемского, командовал бригадой в составе 2-й пехотной дивизии генерала Бурка при захвате Виго и Коруньи, в 1824 г. уехал во Францию.
В 1832 г. – генерал-капитан Галисии, принимал участие в боевых действиях против карлистов.
Умер автор мемуаров, относящихся к периоду войню в Южной Америке 27 июля 1837 г. в Бареже в возрасте 62 лет.
Похоронен на кладбище Лю-Сен-Совёр.
8 августа 1843 г. прах генерала перенесён на кладбище Св. Исидора в Мадриде.
Морильо-и-Морильо,