Epidemiologische Studien schätzen jedes Infektionsergebnis auf 1,4 bis 3,9 neue Ergebnisse, wenn keine Mitglieder der Gemeinschaft immun sind und keine präventiven Maßnahmen ergriffen werden. Das Virus wird hauptsächlich durch engen Kontakt und über Atemtröpfchen, die durch Husten oder Niesen entstehen, zwischen Menschen verbreitet. Es gelangt hauptsächlich in menschliche Zellen durch Bindung an den Rezeptor Angiotensin-Converting-Enzym 2 (ACE2).
Reservoir
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DIE ERSTEN BEKANNTEN Infektionen des SARS-CoV-2-Stamms wurden in Wuhan, China, entdeckt. Die ursprüngliche Quelle der viralen Übertragung auf den Menschen bleibt unklar, ebenso wie ob der Stamm vor oder nach dem Spillover-Ereignis pathogen wurde. Da viele der ersten Personen, die mit dem Virus infiziert waren, Arbeiter auf dem Huanan Seafood Market,it waren, wurde vermutet, dass der Stamm vom Markt stammen könnte. Jedoch,andere Untersuchungen zeigen, dass Besucher das Virus auf den Markt eingeführt haben können, was dann eine schnelle Expansion der Infektionen erleichtert.
Die Erforschung des natürlichen Reservoirs des Virusstamms, der den SARS-Ausbruch 2002–2004 verursachte, hat zur Entdeckung vieler SARS-ähnlicher Fledermauskoronaviren geführt, die am häufigsten aus der Rhinolophus-Gattung von Hufeisenfledermäusenstammen, und zwei virale Nukleinsäuresequenzen, die in Proben aus Rhinolophus sinicus gefunden wurden, zeigen eine Ähnlichkeit von 80% mit SARS-CoV- 2.Eine dritte virale Nukleinsäuresequenz aus Rhinolophus affinis, gesammelt in der Provinz Yunnan und raTG13, hat eine 96%ige Ähnlichkeit mit SARS-CoV-2.Bats gelten als das wahrscheinlichste natürliche Reservoir von SARS-CoV-2, aber Unterschiede zwischen dem Fledermaus-Coronavirus und SARS-CoV-2 deuten darauf hin, dass Menschen über ein Zwischenhost-Zwischenland infiziert wurden.
Eine metagenomische Studie, die 2019 veröffentlicht wurde, hatte zuvor gezeigt, dass SARS-CoV, der Stamm des Virus, der SARSverursacht, das am weitesten verbreitete Coronavirus unter einer Probe von Sunda Pangolinswar. [50] Am 7. Februar 2020 wurde bekannt, dass Forscher aus Guangzhou eine Pangolin-Probe mit einer viralen Nukleinsäuresequenz "99% identisch" mit SARS-CoV-2 entdeckt hatten. [51] Bei der Veröffentlichung stellten die Ergebnisse klar, dass "die Rezeptor-bindende Domäne des S-Proteins des neu entdeckten Pangolin-CoV praktisch identisch mit der von 2019-nCoV ist, mit einem Aminosäureunterschied." amino acid [52] Pangolins sind nach chinesischem Recht geschützt, aber ihre Wilderei und ihr Handel für den Einsatz in der traditionellen chinesischen Medizin bleiben weit verbreitet. [53][54]
Mikrobiologen und Genetiker in Texas haben unabhängig voneinander Beweise für eine Neusortierung in Coronaviren gefunden, die auf eine Beteiligung von Pangolinen am Ursprung von SARS-CoV-2 hindeuten. [55] Pangolin-Coronaviren, die bisher gefunden wurden, teilen jedoch höchstens 92 % ihres gesamten Genoms mit SARS-CoV-2, wodurch sie weniger ähnlich als RaTG13 zu SARS-CoV-2 sind. [56] Dies reicht nicht aus, um zu beweisen, dass Pangoline der Zwischenwirt sind; im Vergleich dazu teilte das SARS-Virus, das für den Ausbruch 2002–2004 verantwortlich war, 99,8 % seines Genoms mit einem bekannten Zivet-Coronavirus.
HUFEISENNASE gehören zu den wahrscheinlichsten natürlichen Reservoirs von SARS-CoV-2
Phylogenetik und Taxonomie
SARS-CoV-2 gehört zur breiten Familie von Viren, die als Coronavirenbekanntsind. Es ist ein positiv-sinnliches einsträngiges RNA-Virus (+ssRNA). Andere Coronaviren sind in der Lage, Krankheiten zu verursachen, die von Erkältung bis hin zu schwereren Krankheiten wie dem Middle East Respiratory Syndrom (MERS) Middle East respiratory syndrome reichen. Es ist das siebte bekannte Coronavirus, das Menschen infiziert, nach 229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV, und dem ursprünglichenSARS-CoV. [57]
Wie der SARS-bezogene Coronavirus-Stamm, der in den SARS-Ausbruch 2003 verwickelt war, ist SARS-CoV-2 ein Mitglied der Untergattung Sarbecovirus (Beta-CoV-Linie B). [58][59] Seine RNA-Sequenz ist etwa 30.000 Basen lang. SARS-CoV-2 ist einzigartig unter den bekannten Betacoronaviren in seiner Integration einer polybasistischen Spaltungsstelle, ein Merkmal, das bekanntermaßen die Pathogenität und Übertragbarkeit bei anderen Viren erhöht. [60][61]
Mit einer ausreichenden Anzahl von sequenzierten Genomenist es möglich, einen phylogenetischen Baum der Mutationsgeschichte einer Familie von Virenzu rekonstruieren. Bis zum 12. Januar 2020 wurden fünf Genome von SARS-CoV-2 von Wuhan isoliert und vom Chinese Center for Disease Control and Prevention (CCDC) und anderen Institutionen gemeldet; [62] Die Zahl der Genome stieg bis zum 30. Januar 2020 auf 42. [63] Eine phylogenetische Analyse dieser Proben zeigte, dass sie "in hohem Maße mit höchstens sieben Mutationen im Vergleich zu einem gemeinsamen Vorfahrenverwandtwaren", was darauf hindeutet, dass die erste menschliche Infektion im November oder Dezember 2019 aufgetreten ist. [63] Am 27. März 2020 waren 1.495 SARS-CoV-2-Genome, die auf sechs Kontinenten untersucht wurden, öffentlich zugänglich. [64]
Am 11. Februar 2020 gab das Internationale Komitee für Taxonomie von Viren (ICTV) bekannt, dass nach den bestehenden Regeln, die hierarchische Beziehungen zwischen Coronaviren auf der Grundlage von fünf konservierten Sequenzen von Nukleinsäurenberechnen, die Unterschiede zwischen dem,was damals 2019-nCoV genannt wurde, und dem Virusstamm aus dem SARS-Ausbruch von 2003 nicht ausreichten, um sie zu getrennten Virusartenzumachen. Daher identifizierten sie 2019-nCoV als Stamm strain des schweren akuten respiratorischen Syndrom-bezogenen Coronavirus. [2]
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| NCBI Genom-ID | MN908947 |
| Genomgröße | 29.903 Basen |
| Jahr der Fertigstellung | 2020 |
STRUKTURBIOLOGIE
Jedes SARS-CoV-2 Virion hat einen Durchmesser von etwa 50–200 Nanometern. Wie andere Coronaviren hat SARS-CoV-2 vier strukturelle Proteine, bekannt als S (Spike), E (Hüllkurve), M (Membran) und N(Nukleocapsid) Proteine; das N-Protein hält das RNA-Genom, und die S-, E- und M-Proteine bilden zusammen die virale Hülle. [65] Das Spike-Protein, das auf atomarer Ebene mittels kryogener Elektronenmikroskopieabgebildetwurde[[66][67] ist das Protein, das dafür verantwortlich ist, dass sich das Virus an die Membran einer Wirtszelle anheftet und mit ihr verschen wird.
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AUFBAU EINES SARSR-CoV-Virions
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