В городах федерального значения Москве, Санкт-Петербурге местное самоуправление осуществляется в соответствии с их уставами на внутригородских территориях. Главной особенностью осуществления местного самоуправления в Москве, Санкт-Петербурге является то, что определение в них перечня вопросов местного значения, источников доходов местных бюджетов, состава муниципального имущества внутригородских муниципальных образований осуществляется городскими законами, исходя из необходимости сохранения единства городского хозяйства.[4]
Так, установленные Федеральным законом от 06.10.2003 № 131-ФЗ, другими федеральными законами источники доходов местных бюджетов, не отнесенные законами Москвы и Санкт-Петербурга к источникам доходов бюджетов внутригородских муниципальных образований, зачисляются в бюджеты Москвы и Санкт-Петербурга. Предусмотренные федеральными законами полномочия органов местного самоуправления по решению вопросов местного значения осуществляются органами местного самоуправления внутригородских муниципальных образований Москвы и Санкт-Петербурга в том случае, если соответствующие вопросы определены как вопросы местного значения законами Москвы и Санкт-Петербурга.
ЗАТО признается имеющее органы местного самоуправления территориальное образование, в пределах которого расположены промышленные предприятия по разработке, изготовлению, хранению и утилизации оружия массового поражения, переработке радиоактивных и других материалов, военные и иные объекты, для которых устанавливается особый режим безопасного функционирования и охраны государственной тайны, включающий специальные условия проживания граждан (ст. 1 Закона РФ от 14.07.1992 № 3297-1 «О закрытом административно-территориальном образовании»). Решение о создании (преобразовании), реорганизации ЗАТО принимается Президентом РФ по предложениям Правительства РФ. Предложение об установлении административной подчиненности, об установлении и (или) изменении границ создаваемого (преобразуемого), реорганизуемого ЗАТО вносится Правительством РФ по согласованию с органами государственной власти субъектов РФ, в ведении которых находятся соответствующие территории, органов местного самоуправления. Территория и границы ЗАТО определяются исходя из особого режима безопасного функционирования предприятий и (или) объектов, а также с учетом потребностей развития населенных пунктов. Границы ЗАТО на период действия особого режима безопасного функционирования могут не совпадать с границами субъектов РФ. При установлении и (или) изменении границ ЗАТО и при его реорганизации требования законодательства РФ об учете мнения населения не применяются.
ЗАТО находится в ведении федеральных органов государственной власти по вопросам: установления административной подчиненности, границ указанного