Вторая, переходная, стадия долговременной адаптации к физическим нагрузкам определяется тем, что возникающая активация синтеза нуклеиновых кислот и белков, вызванная дефицитом энергии, приводит к избирательному росту структур и «расширяет» звенья, ограничивающие интенсивность и длительность адаптационной реакции. Нейрогормональная регуляция в результате активации синтеза белков развивает консолидацию – фиксацию временных связей и целых условнорефлекторных стереотипов, обеспечивающих новые двигательные навыки. Возрастает степень координации движений, участие «лишних» мышц исчезает, двигательная реакция становится более экономной. Формируются временные связи, обеспечивающие развитие координации между аппаратом движения, системами кровообращения и дыхания; их деятельность экономизируется, несмотря на более интенсивную двигательную реакцию. Активный синтез нуклеиновых кислот и белков в скелетных мышцах, сердце, дыхательных мышцах и рабочих органах приводит к увеличению массы и мощности внутриклеточных систем транспорта и митохондрий. Быстрое усвоение пирувата и жирных кислот уменьшает лакцидемию, содержание аммиака, дефицит гликогена, КрФ и совершает другие сдвиги, нарушающие гомеостаз. Уменьшается стресс-реакция, т. е. концентрация в крови катехоламинов, глюкокортикоидов и др. гормонов. В итоге снижается ферментемия, происходят распад белков, нарушение азотистого баланса и др. явления повреждения. Звенья, лимитирующие двигательную реакцию, расширяются, ее интенсивность и длительность возрастают.
Третья стадия процесса, стадия устойчивой адаптации и формирование доминирующей функциональной системы, характеризуется развитием системного структурного следа. На уровне нейрогуморальной регуляции это выражается в формировании устойчивого условнорефлекторного динамического стереотипа и увеличении двигательных навыков. За счет экстраполяции повышается возможность быстрой перестройки двигательной реакции в ответ на изменения требований среды. Условнорефлекторные связи налаживают устойчивую координацию между циклами двигательной реакции и дыханием, кровотоком и вентиляцией отделов легких. Увеличиваются плотность адренергической иннервации сердца, количество адренорецепторов и активность аденилатциклазы и фосфодиэстеразы в скелетных мышцах и сердце. Адренергическая мобилизация сократительной функции достигается меньшей активацией адренергической системы и количеством катехоламинов. Наблюдается выраженная гипертрофия и гиперфункция надпочечников.
Двигательный аппарат характеризуется выраженной гипертрофией скелетных мышц с увеличением количества и массы митохондрий на единицу ткани и накоплением мембранных белков; растет АТФазная