Это объяснение было принято многими христианами, ставшими несторианцами. Но оно не согласовывалось с духом и сутью христианского учения и потому было осуждено как ересь на Эфесском Вселенском соборе (431 г.). После этого несторианцы подверглись гонениям, оказались в Сирии, а затем – на огромных культурных территориях, от Китая и Монголии до Северного Урала.
Если несториане подчеркивали человеческую природу Иисуса, сына Давидова, распятого на кресте, то представители другого направления в христианском богословии, монофизиты, напротив, считали, что Иисус Христос обладает только божественным естеством. Монофизитов называют также яковитами, по имени епископа Сирии и Центральной Азии Якова Барая, который 40 лет провел в скитаниях по землям Малой Азии, Египта и Сирии, надеясь поддержать и объединить монофизитов. Однако и это направление было осуждено на четвертом Халкидонском соборе (451 г.) Монофизиты, как и несториане, не отказались от своих взглядов и были вынуждены избрать другие культурные регионы.
На территорию Казахстана христианство проникает из Сирии и Персии сначала в форме несторианства (V в.), а чуть позже – и в форме монофизитства (VII в.). Конечно, местное население ничего не знало о богословских спорах, об утверждении догмата богочеловечности Иисуса Христа. Скорее всего, для оседлого и полукочевого населения понятными и приемлемыми были взгляды несторианцев и яковитов, поскольку они наиболее соответствовали уже воспринятым в степи культам Тенгри, Митры, Ахура-Мазды.
Наиболее интенсивно несторианское учение распространялось в Южном Казахстане и в Семиречье. В VII—VIII вв. в этом регионе действовало множество христианских церквей. Тюркский Каган Арслан Иль Тюрчюк обратился даже к несторианскому митрополиту Тимофею с просьбой основать в Семиречье самостоятельную митрополию (объединение христианских церквей). Христианское население проживало также в Таразе, Мерке, Навакете, где были построены величественные соборные церкви. По свидетельству В. В. Бартольда, христианами было тюркское племя джикили, жившее неподалеку от Тараза, а также огузы, проживающие в низовьях Сырдарьи, уйгуры в Восточном Туркестане, канглы на территории между Таласом и озером Иссык-Куль, найманы в западной части современной Монголии. При патриархе Тимофее «…христианство было принято царем тюрок, видимо карлукским джагбу. На рубеже IX—X вв. была образована особая карлукская митрополия… христиане проживали и в городах по Сырдарье. В XII веке была учреждена митрополия Кашгара и Навакета».23
В XII в. в столице гурханов была также учреждена несторианская митрополия. Известен факт о существовании на берегу Иссык-Куля христианского