Восточная часть улуса Джучи (Белая Орда) была разделена между его сыновьями Ордой и Шейбаном. Последнему принадлежала территория к северу от Сырдарьи, между реками Яик (Урал), Иртыш и Чу.
В Орде в середине XIV в. начался период «великой замятки», когда ханы менялись с каледоскопической быстротой. Золотая Орда начинает распадатся.
Монгольская империя, объединявшаяся вначале сильной властью, способствовала возрождению торговли между западом и востоком через Туркестан, где важными торговыми пунктами были Отрар, Алмалык, Каялык. Стали развиватсья торговые связи России со Средней Азией. Русские удельные князья ездили в Орду за ярлыками на правление. Они также принимали участие в походах монголов против их врагов. Русские ремесленники, служилые и торговые люди находились на службе у великого хана (кагана). Монгольское государство недолго оставалось единым. Уже при кагане Хубилае, избранном на курултае, чингизиды правили в Китае, Индокитае и Монголии, а на остальных завоеванных территориях власть кагана была номинальной[8].
С приходом монголов в Дешт-и-Кипчак происходит их смешивание с местными тюркскими племенами. Племена удела Шейбана и мангыты (ногайцы) – монгольское племя, отделившиеся от Золотой Орды в период междоусобиц, откочевали на земли между устьем Волги и Дона, частью к низовьям Сырдарьи, где смешались с местными тюркскими племенами. В эпоху Тимура и Тимуридов они стали известны в Средней Азии под именем кочевых узбеков. В XV в. началось их объединение под главенством потомка Чингиз-хана из рода Шейбана Абулхайр-хана (1428–1468). Он был возведен на престол в одном из городов Сибири представителями рода Шейбана, казахами и мангытами[9].
Абулхайр-хан овладел укреплениями на Сырдарье – Сыгнаком, Сузаком и др. В 1448 г. он совершил набег на Мавераннахр и разрушил Самарканд. После смерти Абулхайр-хана в 1458 г. его государство распалось. Его внук Шейбани, которого поддержало племя мангытов, владевших крепостями на Сырдарье, укрепив свою власть в Дешт-и-Кипчаке, начинает борьбу за Мавераннахр и Хорасан. В 1499–1510 гг. он завоевывает государство Тимуридов и занимает Бухару, Самарканд, Ургенч, Герат, Кандагар, т. е. всю территорию Мавераннахра и Хорасана. Памирские княжества подчинялись ему номинально. Военный поход против горных племен Герата сильно ослабил войска Шейбани-хана.
На западе Хорасана началось вторжение основателя государства Сефивидов шаха Исмаила (1502–1524). В 1510 г. шах Исмаил осадил Мерв. В сражении под Мервом Шейбани-хан был убит. Шах Исмаил захватил Мерв и Герат, началось возвышение династии тимуридов, прежде всего Бабура, правившего в Кабуле, в Афганистане.