На участке № 3 в XVIII и начале XIX века стояли небольшие деревянные строения. В одном из них находился «Кофейный дом». В 1810-х годах возвели каменное двухэтажное здание, которое до самой революции занимали мелкие торговые заведения. На его месте в 1960-х годах с некоторым отступом от красной линии был сооружен трехэтажный корпус детского сада.
Угловой участок № 5/5 начал застраиваться в первой половине XVIII века, здесь находился деревянный одноэтажный дом, обращенный протяженным фасадом в переулок. Планы начала XIX века показывают здесь каменное двухэтажное здание на подвалах, выходящее главным фасадом на 6-ю линию. В 1835 году его надстроили третьим этажом, а в 1902-м – четвертым и пятым. В том же году вдоль переулка возвели пятиэтажный корпус по проекту гражданского инженера А.М. Воробьева (см.: 6-я линия, № 5/5).
Дом № 7/4 на углу переулка и 7-й линии был возведен в 1720 – 1730-х годах и имел два этажа на высоких подвалах. В 1840 году архитектор И.А. Цим надстроил его третьим. В 1874 году архитектор Л.Л. Петерсон возвел двухэтажный флигель на углу Академического и Днепровского переулков (см.: 7-я линия, № 4/7).
Застройка участка № 9/3, вытянутого вдоль переулка, началась в первой половине XVIII века. Первое каменное здание, одноэтажное, возвели на углу 8-й линии. В дальнейшем оно надстраивалось и к 1840-м годам стало четырехэтажным (см.: 8-я линия, № 3/9).
Строения по четной стороне переулка представляют собой тыловые, часто хозяйственные флигели выходящих на набережные Большой Невы парадных зданий.
Двухэтажный дом № 2/2 на углу 5-й линии, возведенный во второй половине XVIII века, – это один из флигелей дома № 19 по Университетской набережной (см.).
Двухэтажный дом № 4 – дворовый флигель дома № 21 по Университетской набережной (см.). Он возведен в 1871 году по проекту архитектора Х.И. Грейфана.
Под № 6 – двор дома № 23 по Университетской набережной. В начале XX века на месте старинных деревянных служб разбили сад.
Наиболее интересным с архитектурной точки зрения является дом № 8 – пример стиля барокко. К 1760-м годам здесь стоял двухэтажный каменный дом с замкнутым двором, в который выходили двухъярусные галереи. В 1780-х годах он принадлежал известной купеческой фамилии Чиркиных. В начале XX века здание надстроили третьим этажом.
Двухэтажный каменный дом № 10/3 на углу переулка и 6-й линии возвели в начале 1800-х годов. В 1870-х годах архитектор И.А. Цим надстроил его третьим этажом (см.: 6-я линия, № 3/10).
Трехэтажный, на подвалах, дом № 12/2 на углу 7-й линии был сооружен во второй половине XVIII века. В начале XIX века подвергся перестройке, получил обработку фасада в формах классицизма. Является флигелем знаменитого «дома академиков» (см.: набережная Лейтенанта Шмидта, № 1/2).
На участке № 14 к середине XVIII века имелся каменный одноэтажный, на подвалах, флигель. В 1823 году