Следствие по делу митрополита Пахомия вел архимандрит Переславль– Залесского Никитского монастыря Иосиф. По окончании следствия, в 1725 г. он был хиротонисан на Воронежскую кафедру. В Воронеж он прибыл в феврале 1726 г., но в том же году был вызван в Санкт-Петербург, по пути заболел и скончался в Москве, был погребен в Андроникове монастыре.
Иосиф I был последним архипастырем, возглавлявшим Воронежскую епархию при жизни Петра I. Со смертью Петра I изменилось и само положение епархии.
1 марта 1727 г. в епископа Воронежского был хиротонисан архимандрит Владимирского Горицкого монастыря Лев (Юрлов). Судьба этого человека была полна драматических событий. В юности он служил пажем при дворе, но совершив проступок и опасаясь гнева Петра I, он, по совету царицы Марфы Матфеевны, скрылся в Вологодских лесах, где принял иночество. Возрастая духовно, он со временем возглавил монастырскую братию, а затем и епархиальную паству. Для посвящения в епископы архимандрит Лев прибыл в Москву, где ему пришлось задержаться на полгода, чтобы совершать заупокойное служение по почившей императрице Екатерине I, а потом торжественное о возведении на престол государя Петра II. В свою епархию владыка прибыл только 11 сентября 1727 г. Но править ему суждено было недолго, епископ стал жертвой интриг воронежского губернатора Пашкова. В 1730 г. он был вызван в Москву, лишен епархии, сана и отправлен в заточение. Лишь по восшествии на престол государыни Елизаветы Петровны, в 1742 г. бывший епископ Воронежский был признан невиновным. Он прибыл в Петербург, где в присутствии Св. Синода на него были возложены омофор и панагия, но от управления епархией епископ Лев отказался и провел последние годы жизни в Московском Знаменском монастыре.
После отстранения владыки Льва (Юрлова), летом 1730 г. на Воронежскую кафедру был назначен епископ Иоаким (Струков). Новый владыка сам был родом из Воронежской губернии, но успел стать известным пастырем в Москве, служил в Благовещенском соборе Кремля, был игуменом Тверского Селижарова монастыря, келярем Чудова монастыря, архимандритом Донского монастыря, три года провел в морских экспедициях в должности Флотского обер-иеромонаха.
В Воронеже его правление, в первую очередь, ознаменовалось открытием мощей свт. Митрофана в 1832 г. Епископ приложил много сил к строительству Благовещенского собора и архиерейского дома. На свои средства устраивал церковную утварь и украшения. В Благовещенском соборе его усердием были сооружены золотые сосуды и оклад иконы Божией Матери Одигитрии. При нем был отлит большой колокол в 580 пудов, поднятый на колокольню в 1748 г., позже, в 1770 г. он был перелит в другой колокол, семисотонный. Владыка построил каменную церковь Николая Чудотворца в родном с. Нелжи, впоследствии в храме бережно хранилось его архиерейское место и портрет епископа во весь рост.
Приемник Иоакима, епископ Вениамин (Сахновский; 1742–1743) пробыл на Воронежской