По прошению прихожан, епископ Суздальский и Владимирский Виктор благословил переименовать престол в Захарии-Елизаветинском храме в память Преображения Господня, а в трапезе этого храма устроить придел свв. прав. Захарии и Елизаветы, в память прошлого наименования храма. Этот придел был освящен в 1804 г., по благословению епископа Суздальского и Владимирского Ксенофонта, иеромонахом Никоном, настоятелем Лукиановой пустыни и префектом Владимирской семинарии. Приблизительно в то же время появилась каменная колокольня. В советское время храм был закрыт, разрушена колокольня.
Успенский женский монастырь. Есть известия, что первоначально, Успенская церковь и монастырь были построены Иваном Грозным вблизи своего дворца в XVI в. Но если монастырь и существовал в те годы, то очень скоро он прекратил свое существование.
Действительное начало Александровскому Успенскому женскому монастырю положил прп. Лукиан в 1642 г., став постригать в иночество жительниц Александрова. Монахини, первоначально, ютились около Успенского храма.
По просьбе прп. Лукиана, царь Алексей Михайлович передал для женской обители постройки времен Ивана Грозного, стоявшие на т. н. Буграх и находившиеся в запустении, а также остатки дворцовых строений, Покровский и Троицкий храмы. Так, во второй половине XVII в. Бывший кремль стал обителью. Монастырское предание гласит, что уцелевшее при Успенской церкви монастыря каменное здание есть часть дворца царя Ивана Грозного. Прп. Лукиан, утвердив иноческое житие, поставил первую игуменью старицу Евпраксию.
Наряду с прп. Лукианом, в Александрове почитался и другой подвижник – прп. Корнилий – игумен Лукиановой пустыни и духовник Успенского монастыря. Он скончался 11 августа 1681 г. и был погребен под алтарем Троицкого собора.
На протяжении своей истории, монастырь украшался царскими щедротами. Почти ежегодно посещал обитель царь Федор Алексеевич. Ему особенно нравились дорогие кони, которые были на государевом дворе.
В 1708 г. в монастыре был свт. Дмитрий Ростовский и пел обедню и панихиду по царевне монахини Маргарите.
В 1923 г. Успенский женский монастырь был закрыт. В нем разместили историко-архитектурный музей. В 1946 г. Троицкий собор был открыт как приходской храм.
В 1991 г. после многих лет монастырь был восстановлен. Для богослужений был открыт Троицкий собор. Священником его стал о. Андрей Устюжанин, сын Клавдии Устюжаниной, пережившей смерть и воскрешение (т. н. «Барнаульское чудо»).
В 1995 г. были обретены мощи прп. Корнилия, и положены в правом приделе собора.
Зосимова пустынь в Арсаках. Об основателе Зосимовой пустыни сведений сохранилось очень мало. Со слов слепого старца Симеона Ермолаева, служившего несколько лет