После смерти Ивана Грозного, Слобода пришла в запустение. В литовское разорение слободу разграбил гетман Ян Петр Сапега. Князь Скопин-Шуйский построил здесь острог и осенью 1609 г. разбил Сапегу у с. Каринского. В Александровской слободе Прокопий Ляпунов предложил Скопину царский венец.
Царь Михаил Федорович велел привести слободу в благообразный вид, построить покои для царя и царицы, чтобы они могли остановиться здесь по пути на богомолье в Переславль или Юрьев. Так, в 1638 г. царь Михаил Федорович с супругой Евдокией Лукьяновной останавливались здесь, возвращаясь из Переславля.
В 1649 г. было положено начало Александровскому Успенскому женскому монастырю.
В 1687 г. на обратном пути из Переславля, Александрову слободу посетили цари Иван и Петр Алексеевичи. Когда слобода стала собственной вотчиной Петра I, в 1689 г. здесь он прожил целую неделю. После смерти Петра I слобода перешла во владение Елизаветы Петровны, которая подолгу здесь жила. После смерти императрицы, слобода перешла Петру III, затем Екатерине Великой и при ней стала уездным городом.
В начале 1920-х гг. в Александрове отбывал ссылку епископ Вятский Павел (Борисовский). В 1927 г. он стал членом Временного Патриаршего Св. Синода, а в 1929 г. занял Ярославскую и Ростовскую кафедру, впоследствии, в 1937 г. епископ был расстрелян. В 1933 г. после трехлетнего заключения в концлагере и ссылки, проведенной в Юрьев-Польском в Александрове поселилась Татьяна Николаевна Гримблит. Она устроилась работать фельдшером в больницу. В 1936 г. Татьяна Николаевна переехала в Московскую область, где 23 сентября 1937 г. была расстреляна в Бутово. Татьяна Николаевна Гримблит прославлена Русской Православной Церковью в лике мучениц.
Собор Рождества Христова. Предположительно, первый собор Рождества Христова был построен при Иване Грозном, когда слобода пополнилась жителями и нуждалась в приходском храме.
В 1627–1630 гг. упоминаются две церкви: Рождества Христова и свт. Николая Чудотворца. В 1649 г. Рождественская церковь была перестроена. В 1653 г. перестроена Никольская церковь, в ней был освятили придел св. пророка Илии и св. Иоанна Предтечи.
В 1696 г. вместо этих двух деревянных церквей был построен каменных храм Рождества Христова с приделом свт. Николая. В 1847 г. этот храм был расширен на средства купца И. Баранова, и с того времени существовал без изменений. Престолов в нем три: в холодном храме Рождества Христова, в теплых приделах – Архистратига Михаила и свт. Николая Чудотворца.
К собору Рождества Христова была приписана кладбищенская церковь Боголюбской иконы Божией Матери, построенная в 1800 г. на средства благотворителей и в 1829 г., иждивением александровских купцов Михаила Каленова и Федора Баранова, добавленная приделами св. Федора Стратилата и св. мч. Варвары.
В