С кончиной знатных инокинь, их имущество, родовые драгоценности и вотчины поступали в собственность монастыря. Так Покровский монастырь стал одним из самых богатых в России, а ризница его хранила много ценных предметов.
Главный храм монастыря – Покровский собор, был освящен епископом Суздальским и Тарусским Симеоном 1 октября 1518 г., в день праздника Архистратига Михаила. В его стенах были погребены: прав. Соломония (Сабурова), дочь царя Василия Шуйского Анастасия (маленькое надгробие рядом с гробницей Соломонии), сестра великого князя Василия Ивановича инокиня Александра, супруга Ивана Грозного Анна Колтовская, княгиня Александра Полоцкая, княгиня инокиня Евфимия Щемячищева, княгиня Евпраксия и племянница ее Ирина Нагих, жена Ивана Ивановича Шуйского инокиня Марфа, княгиня инокиня Анастасия Кислых, и другие жены из родов Ногтевых, Татевых, Скопиных, Бельских. Всего под спудом Покровского собора двадцать семь исторических гробниц.
В иконостасе Покровского собора находятся иконы 1688–1689 гг., принадлежащие кисти Артемия Катунцова, ученика Симона Ушакова. Икона Николая Чудотворца, превосходного новгородского письма, была принесена в обитель инокиней Александрой Сабуровой. Другая интересная икона «Ты еси иерей во век по чину Мелхиседекову», превосходных последних новгородских писем, ею в 1559 г. новгородский архиепископ Леонид благословил сына Ивана Грозного царевича Ивана Ивановича.
Теплая церковь во имя Зачатия св. Анны, построена в конце XVI в. В древности, при ней упоминался Смоленский придел. В конце XVII в. церковь была перестроена и лишилась былых украшений. 29 октября 1783 г. храм был заново освящен епископом Суздальским и Юрьевским Тихоном.
На месте небольшой кельи Соломонии Сабуровой, под колокольней, появилась церковь Происхождения Происхождения Честных Древ Животворящего Креста Господня.
На святых воротах была устроена церковь Благовещения с приделами Св. Троицы и Архистратига Михаила. Освящена 30 августа 1706 г. Рядом, в ограде, находились покои царицы Евдокии Лопухиной и именно с ее именем связывают устроение этой