Именно поэтому столкновение между Помпеем и Цезарем, также добивавшимся единоличной власти, было неизбежно. Однако Помпей признавался оптиматами прежде всего в качестве военного вождя, способного подавить волнения в Риме. Поэтому в 50 году до н. э. ему было поручено командование всеми римскими войсками. Одновременно сенат принял решение, согласно которому Цезарю надлежало распустить свои легионы и явиться в Рим. Но он прекрасно понимал, что такое решение означает для него смертный приговор. 10 января 49 г. до н. э., произнеся знаменитую фразу «жребий брошен», Цезарь вместе со своими легионами перешел через реку Рубикон, отделявшую Италию от Галльских провинций, и двинулся на Рим.
Помпей, не сумев организовать достойного сопротивления, бежал в Грецию. Цезарь, без труда овладев Римом, двинулся не в погоню за своим противником, а в Испанию, где были сосредоточены основные силы помпеянцев. Захватив Испанию и вытеснив остатки верных Помпею войск в Африку, Цезарь вернулся в Рим. В конце 49 г. до н. э. его легионы переправились в северо-западную Грецию, в Эпир. Именно там его ожидал Помпей. Решающая битва произошла у фессалийского города Фарсала, где верные Помпею войска были наголову разбиты. Сам он бежал, но при попытке высадиться в Египте был убит. Армия Цезаря переправилась в Египет, где после короткой войны последний оставшийся в живых триумвир утвердил на троне птолемеевского государства царицу Клеопатру. После этого он окончательно подавил сопротивление остатков помпеянцев в Африке и в Испании. К 45 г. до н. э. Цезарь становится единоличным правителем всей огромной Римской державы.
Еще в ходе гражданской войны Цезаря трижды назначали диктатором на разные сроки. В 44 г. до н. э., уже после установления его единоличной власти, сенат был вынужден провозгласить Цезаря диктатором на вечные времена. Теперь его диктатура вполне легализовала единовластие правителя и фактически означала монархическую власть.
Будучи диктатором, Цезарь избирался консулом, ему были присвоены трибунские полномочия, он располагал правом цензора. Цезарю даровался пожизненный титул императора, ставший составной частью его имени, а также титул «отца отечества». Первый подчеркивал связь диктатора с войсками, второй знаменовал его узы с римским народом. Таким образом, в руках Гая Юлия Цезаря были сосредоточены несколько магистратур. Но именно это и противоречило республиканской традиции, исключавшей совмещение столь значительных должностей в руках одного лица. Фактически же это гарантировало диктатору единоличную власть.
Были осуществлены попытки дать и религиозное обоснование его правления. Цезарь стал верховным жрецом, в его честь устраивались