Возмущенные новгородцы опустошили в ответ ряд великокняжеских земель московских. Между тем на севере, в наиболее промышленно развившейся Двинской области, зрело недовольство господством Новгорода. Двинские бояре-землевладельцы хотели вести торговлю самостоятельно, без тяготивших их теперь связей с Великим Новгородом. Этим воспользовался великий князь Московский Василий I. Он предложил через своих посланцев двинским боярам «отложиться» от Новгорода и «задаться» за великого князя Московского. Большая часть двинских бояр согласилась на это, у отказавшихся земли были отобраны силой. Василий I наградил двинских бояр «Уставной грамотой», которая давала им право беспошлинной торговли в княжестве Московском. В начале XV века на отобранные у непокорных бояр земли хлынули переселенцы из Московского княжества. Частью земель завладели монастыри, всемерно развивавшие в своих владениях различные промыслы, особенно солеварение, приносившее им очень значительный доход, поскольку государство, заинтересованное в развитии добычи соли, давало им значительные льготы за сооружение соляных варниц.
Но уже в XVI веке льготы были ограничены и государственное налогообложение стало действенным рычагом в регулировании развития производства и торговли. Торговля перешла в ведение русских купцов (архангельских, устюжских, вологодских и др.). Стали расширяться торговые отношения с Сибирью, через Кяхту установилась торговля с Китаем. Возросла роль Архангельского порта в торговле с Западной Европой.
Открытое Петром I «окно в Европу» построением Петербурга, а позднее выход к Черному морю, создали для русской торговли необходимое ей единое торговое пространство. Продолжалась торговля через Ганзейский союз. К концу XIX века Россия заняла в ряду европейских членов этого союза 4-е место. По данным 1893 года торговый оборот Англии в Ганзейском союзе составлял 13 миллионов марок, Германии соответственно – 7, Франции – 6 и России – 4 миллиона марок. Но при этом в России импорт превышал экспорт, а вывозились преимущественно природные и сырьевые ресурсы. Природные богатства края представлялись неисчерпаемыми, а уровень промышленной культуры русского севера оставался крайне низким, не соответствующим