На момент событий в Ферганской области в Узбекской ССР проживало 109 тысяч турок-месхетинцев, из них в Ферганской области – 16 тысяч, Ташкентской – 44 тысячи, Сырдарьинской – 19 тысяч, Самаркандской – 18 тысяч, Андижанской – 5 тысяч, Наманганской – 3 тысячи, Бухарской – 2 тысячи и Кашкадарьинской области – около 800 человек.
С 3-го по 12 июня 1989 года в Ферганской области произошли массовые беспорядки, которые сопровождались умышленными убийствами турок-месхетинцев, погромами, поджогами и грабежами их домов.
Всего в этот период погибло 112 человек, из них турок-месхетинцев – 51, узбеков – 38, других национальностей – 25. Пострадали, получив различные телесные повреждения, 1032 человека. Сожжено и разгромлено 856 жилых домов и государственных объектов.
В массовых беспорядках в отдельные дни участвовало до 70 тысяч человек. Массовые беспорядки происходили в 15 районах Ферганской области, наиболее интенсивно они происходили в Маргелане, Ташлаке, Коканде, Фергане, Кувасае, Ферганском, Ахунбабаевском и Узбекистанском районах.
По фактам умышленных убийств, по погромам, поджогам и другим преступлениям возбуждались уголовные дела, которые были объединены в 15 уголовных дел о массовых беспорядках применительно к 15 районам, где они происходили.
Для расследования этих преступлений на межнациональной почве была создана следственная бригада Прокуратуры Союза ССР под руководством заместителя начальника следственной части тов. Фролова А. В. Следственная группа состояла из 250 следственно-оперативных работников органов прокуратуры, внутренних дел и государственной безопасности.
К настоящему времени окончено расследованием 207 уголовных дел в отношении 397 человек, из них 178 дел в отношении 364 человек направлены в суд. 29 уголовных дел прекращены по нереабилитирующим основаниям в связи с применением различных мер общественного воздействия.
Более половины умышленных убийств (из 75) раскрыты. Убийства в основном носили жестокий, изуверский характер.
В суды направлено 28 дел в отношении 90 человек по обвинению в умышленных убийствах и покушениях на убийство, по обвинению в участии в массовых беспорядках – 70 дел в отношении 137 человек, по обвинению в хищениях личного имущества – 47 дел в отношении 66 человек, по обвинению в злостном хулиганстве – 5 дел в отношении 20 человек, по обвинению в разжигании национальной розни – 6 дел в отношении 9 человек (другим 11 гражданам разжигание национальной розни вменялось по совокупности преступлений).
Судами Узбекской ССР рассмотрено 128 уголовных дел с вынесением приговоров, в том числе двое приговорены к исключительной мере наказания – расстрелу за умышленные убийства 4 турок-месхетинцев.
О результатах расследования широко информировалось население и общественность.
Расследованы также все случаи применения огнестрельного оружия работниками