Преобразования затронули и органы государственной власти. В 1552 г. была заведена специальная Дворовая тетрадь – полный список Государева двора, в который вошло около 4 тыс. человек. Эти люди именовались дворовыми детьми или дворянами, тогда как бояре и их дети составляли нижний слой служилых людей. В Дворовой тетради дворяне были записаны по тем уездам, в которых они владели землей. Именно из их числа выходила потом дворянская знать: воеводы и городские головы, дипломаты и администраторы. Развивалась и система приказов. Первое письменное упоминание о приказах относится к 1512 г. На момент прихода к власти Ивана IV существовало около 20 приказов, а к концу же века их насчитывалось уже около 30. Наряду с учреждениями общегосударственной власти (например, Посольский приказ, занимавшийся связями с другими государствами, или Разбойный приказ, ведавший судами над «лихими людьми») появляются и территориальные приказы, например приказ Казанского двора. Своеобразной попыткой поставить под контроль приказную и местную администрацию было учреждение Челобитного приказа, который должен был разбирать самые разнообразные жалобы. Суд и административная власть концентрировались теперь в руках губных и земских старост, которые обязаны были заниматься распределением налогов и повинностей, а также осуществлять сыск и следствие по государственным делам.
Естественно, реформы не могли обойти церковную власть на Руси. В январе 1551 г. по инициативе митрополита Макария и царя Ивана Грозного был созван Собор русской церкви. На нем были одобрены как принятие Судебника 1550 г., так и те реформы, которые осуществлялись в Русской земле. Кроме этого, Собор унифицировал церковные обряды, создал единый пантеон святых и принял меры для искоренения пороков в среде духовенства. Церкви запретили заниматься ростовщичеством; кроме того, решено было передать в руки царя все земли, приобретенные церковью до Собора, а впредь приобретать и продавать земельную недвижимость только по разрешению царя. Решения Собора были записаны в сборнике, состоявшем из 100 глав – отсюда и его название «Стоглав».
В ноябре