С началом войны эти обстоятельства были учтены. При реорганизации органов государственной безопасности и внутренних дел приняты меры к усилению контрразведывательной работы на объектах промышленности и транспорта. В июле – августе 1941 г. в системе НКВД СССР были вновь образованы Экономическое и Транспортное управления.[165]
С целью улучшения разведывательной, диверсионной и контрразведывательной работы в тылу немецко-фашистских войск в январе 1942 г. в составе НКВД СССР было образовано 4-е управление.
В ходе реорганизации НКВД, естественно, встал вопрос о ведомственной принадлежности органов военной контрразведки. В тот период, видимо, не было уверенности, что оставление особых отделов в системе НКВД или передача их новому Наркомату государственной безопасности положительно отразится на их деятельности. Особые отделы были переданы в ведение НКО СССР и НКВМФ СССР.
Кроме того, передача в 1943 г. органов военной контрразведки в подчинение Наркоматов обороны и Военно-морского флота, по всей вероятности, диктовалась также изменением военно-политической обстановки, необходимостью совместных действий армии и военной контрразведки на освобожденной от противника советской территории и в тылу врага.
Вопрос о ведомственном подчинении органов военной контрразведки, по мнению автора, должен решаться однозначно: как в мирное, так и в военное время особые отделы должны входить в состав органов государственной безопасности. Нужно отметить, что советская военная контрразведка изначально являлась составной частью органов государственной безопасности с момента их образования. Особый отдел ВЧК был организован 19 декабря 1918 г. путем слияния армейских чрезвычайных комиссий и органов военного контроля Реввоенсовета. И хотя в последующем, вплоть до 1931 г., Реввоенсовет имел право давать Особому отделу задания и контролировать их выполнение[166], последний продолжал быть самостоятельным отделом в системе ОГПУ. Центральный Комитет партии и советское правительство уделяли большое внимание деятельности Особого отдела, укрепляли его партийными и военными кадрами.[167]
Подчинение особых отделов органам военного управления, как нам представляется, вело к отрыву военной контрразведки от органов государственной безопасности, создавало причины покрывательства противоправных и преступных фактов военного командования в связи с