Громоздкий аппарат в условиях реальной угрозы войны требовал срочных изменений. В связи с необходимостью максимального улучшения агентурно-оперативной работы органов государственной безопасности и возросшим объемом работы, проводимой Народным комиссариатом внутренних дел СССР, ее многообразием, 3 февраля 1941 г. принято постановление ЦК ВКП(б) о разделении НКВД СССР на два наркомата: Народный комиссариат внутренних дел СССР и Народный комиссариат государственной безопасности.
В этот же день в соответствии с Указом Президиума Верховного Совета СССР от 3 февраля 1941 г. НКВД СССР был разделен на Народный комиссариат внутренних дел СССР и Народный комиссариат государственной безопасности СССР. Таким образом, органы госбезопасности вновь были выделены из системы внутренних дел.
В соответствии с принятыми решениями на организуемые наркоматы были возложены следующие задачи.
На органы государственной безопасности: ведение разведывательной работы за границей; борьба с подрывной шпионской, диверсионной, террористической деятельностью иностранных разведок на территории СССР; оперативная разработка и ликвидация остатков всяких антисоветских партий и контрреволюционных формирований среди различных слоев населения СССР, в системе промышленности, транспорта, связи, сельского хозяйства и др.; охрана руководителей партии и правительства.[154]
В соответствии с этими задачами в состав НКГБ СССР вошли: секретариат; 1-е управление (организация и ведение внешней разведки); 2-е управление (контрразведка – борьба со шпионажем, диверсионной, террористической и иной подрывной деятельностью иностранных спецслужб на территории СССР); 3-е управление (секретно-политическое – борьба с остатками антисоветских партий и другими враждебными элементами); следственная часть; Управление коменданта Московского Кремля; а также самостоятельные отделы: 1-й отдел (охрана руководителей партии и правительства), 2-й отдел (учетно-статистический и архивы); 3-й отдел (оперативный – наружное наблюдение, установка, аресты, обыски); 4-й отдел (оперативной техники); 5-й отдел (шифровальная и дешифровальная работа, охрана государственной тайны); отдел кадров, административно-хозяйственный и финансовый отдел.
В ходе этой реорганизации постановлением ЦК ВКП(б) и СНК СССР от 8 февраля 1941 г. особые отделы передавались из НКВД в ведение Наркомата обороны и Наркомата Военно-морского флота. Взамен ликвидируемого Особого отдела ГУГБ НКВД были образованы 3-е управления НКО и НКВМФ, подчинявшиеся непосредственно народным комиссарам обороны и Военно-морского флота.[155]
На органы внутренних дел возлагалась: охрана общественной (социалистической) собственности, охрана личной и имущественной безопасности граждан и охрана общественного порядка; охрана государственных