Между тем внутри сицилийской мафии обострилась конкуренция, вылившаяся в две мафиозные войны. Первая из них (1962–1963) началась из-за крупной партии героина, которую будто бы припрятал в ходе доставки за океан наркокурьер Кальчедонио Ди Пиза, хотя формальным поводом стало обнаружение полицией заминированного авто, предназначенного для убийства одного из мафиозных лидеров. Противостояли две группы мафиози: Сальваторе Греко с кланом Корлеонези и братья Ла Барбера, которых поддерживал мафиозный босс Пьетро Торретта. Победил Греко.
В начале семидесятых годов «Коза ностра» занимает ведущую роль в международной наркоторговле, чему способствовало соглашение сицилийских мафиозных боссов Греко и Бадаламенти с американскими собратьями. В 1970-е – 1980-е гг. «Коза ностра» контролировала до 90 % трафика героина в США.
Вторая мафиозная война была более продолжительной: 1978–1983 гг. Ее причиной стало чрезмерное возвышение клана Корлеонези. В ходе настоящих боевых действий были убиты многие видные мафиози и члены их семей. Части видных бандитов пришлось спасаться в США. Война велась не только против «соратников по оружию». Мафия атаковала и государство: 3 сентября 1982 г. были убиты Карло Альберто Далла Кьеза, префект Палермо, его жена и агент полиции Доменико Руссо.
Государство пошло на уступки: был принят закон о снисхождении к раскаявшимся мафиози. Одним из лиц, воспользовавшихся этим законом стал мафиозный босс Томмазо Бушетта, давший в 1984 г. первые показания группе следователей в составе Джованни Фальконе, Паоло Борселлино и их коллег из специального межведомственного комитета (Антимафиозного пула). На основании показаний Бушетты и других раскаявшихся мафиози был подготовлен «максипроцесс» против видных деятелей и рядовых членов «Коза ностра».
Процесс начался 10 февраля 1986 г. Перед судом предстали 400 мафиози. Решением суда в декабре 1987 г. 342 человека были осуждены на общий срок 2665 лет тюрьмы; 19 вождей мафии приговорены к пожизненному заключению. За первым процессом последовали другие. Всего перед судами предстало более 1400 преступников, вина большинства из них была доказана.
В ответ клан Корлеонези в начале 1990-х годов переформировал остатки «Коза ностра» и объявил настоящую террористическую войну государственным структурам. Самыми знаменитыми из покушений стали убийства вернувшегося из Рима судьи Джованни Фальконе и Паоло Борселлино. Фальконе был убит на автостраде близ аэропорта Пунта-Раиси (ныне аэропорт