Открытыми остаются вопросы о расширении использования Россией евро, подписании новых соглашений о торговле сталью, о рыболовстве, фармацевтике, положения о едином режиме разрешения торговых споров, о полетах «шумных» российских самолетов в страны-члены ЕС (в 2002 г. разрешены лишь чартерные рейсы в нестоличные города).
В рамках политического сотрудничества сложилась многоуровневая и стабильная система консультаций в виде двухсторонних саммитов и заседаний Совета сотрудничества (дважды в год), встреч на уровне «Председатель Правительства России – Председатель Комиссии ЕС» (по согласию сторон), встреч старших должностных лиц и экспертов. Тематика консультаций давно уже вышла за пределы двухсторонних отношений и охватывает многие международные проблемы, включая вопросы безопасности, международного терроризма и т. д., подтверждением чего является совместная Декларация об укреплении диалога и сотрудничества по политическим вопросам и вопросам безопасности, принятая в октябре 2000 г. на саммите «Россия – ЕС» в Париже. Определенный потенциал для сотрудничества эксперты усматривают в развитии диалога в формате «ЕС – Россия – США» и подключении России к совместному решению таких вопросов, как управление гражданскими кризисами (последствия природных и техногенных катастроф; ЕС трудно желать лучшего партнера, чем российское МЧС), миротворческие операции (уже есть совместный практический опыт на Балканах и собственно оборонная политика, где Россия при определенных условиях могла бы пойти на военно-техническое сотрудничество с ЕС).
Политическое сотрудничество включает в себя ряд межрегиональных интеграционных проектов, осуществляемых под эгидой ЕС. Крупнейшим из них является «Северное измерение», которое финансируется Европейским инвестиционным банком экологических проектов в российском секторе Балтики (системы канализации и водоочистки в Санкт-Петербурге и Калининграде). Для развития проектов приграничного сотрудничества было получено согласие на разовое объединение средств программ ТАСИС и ИНТЕРРЕГ (программы развития межрегионального сотрудничества ЕС).
На юге европейской субрегиональной интеграции, включающей Средиземноморье, Россия добивается своего выборочного участия в программах МЕДА и выступает за развитие контактов между ЕС и Организацией Черноморского экономического сотрудничества.
В сфере внутренних дел и правосудия обе стороны активно сотрудничают, хотя это направление новое для самого ЕС. Налажены регулярные контакты таможенных органов сторон, в том числе по борьбе с контрабандой, незаконным оборотом наркотиков и двойным декларированием грузов. Установлены контакты между правоохранительными органами России и Европолом, принят совместный