Проделав огромную работу по восстановлению внешнего облика ископаемых организмов (кости которых специально по просьбе Наполеона свозили со всей Европы и стран-колоний), Кювье обратил внимание на то, что все некогда жившие организмы устроены весьма разнообразно и не связаны между собой какими-либо переходными формами. Если бы эволюция имела место, утверждал Кювье, то в ископаемом виде должны были сохраниться переходные виды, но их нигде нет. Аргументы Кювье были весьма убедительны, и интерес к эволюции стал постепенно пропадать.
1.4 Истина рождается в споре: Ж. Кювье и Э. Жоффруа
Помимо этого, довольно серьёзный удар по эволюционизму Кювье нанёс своей победой в знаменитом споре со своим соотечественником, зоологом Этьеном Жоффруа (Сент-Илером) (1772—1844).
В 1830 г. Жоффруа представил в Академию наук отчёт, в котором утверждал, что головоногий моллюск каракатица повторяет строение позвоночного животного, если последнего мысленно перегнуть назад в области пупка. В этом случае внутренности каракатицы будут расположены так же, как у позвоночного животного. Этим Жоффруа хотел доказать, что организацию всех животных можно свести к одному единому плану (типу). Кювье, как креационист, признавал единый план строения, но лишь в пределах каждого типа, которых он насчитывал четыре: позвоночные, членистые, мягкотелые (моллюски) и радиальные.
Попытка свести все живые формы к одной и тем самым доказать их происхождение от одного предка вызвали у Кювье бурный протест. Нарисовав перегнутого назад позвоночного и сравнив его строение со строением каракатицы, он доказал, что единого плана внутреннего строения не получится. В качестве доказательств существования 4-х несвязанных друг с другом типов животных Кювье приводил данные из области эмбриологии, которые брал из недавно опубликованного классического труда известнейшего учёного-эмбриолога К. Бэра. Диспуты между Кювье и Жоффруа в стенах Академии длились целых 2 месяца, из которых Кювье вышел победителем. По всеобщему признанию «Кювье наголову разбил Сент-Илера» (Филипченко,