После успешного расследования в первые недели декабря 1917 г. деятельности центрального стачечного комитета «Союза союзов служащих государственных учреждений», руководившего забастовкой чиновников и ряда других дел, ВЧК сосредоточивает свое внимание на проведении оперативных мероприятий, связанных со скорым открытием в Петрограде Учредительного собрания.
К этому времени сформировалось руководящее ядро ВЧК – коллегия, члены которой утверждались Советом Народных Комиссаров, что еще раз подтверждало ее подконтрольность СНК и в дальнейшем вызывало нападки на данный порядок назначений со стороны левых эсеров[102]. Уже 8 декабря 1917 г. руководящий состав ВЧК начал претерпевать изменения. Не вошедшие по различным причинам в ВЧК Г.К. Орджоникидзе, К.А. Петерсон, В.К. Аверин, В.А. Трифонов и В.Н. Васильевский из первоначального списка принятого СНК 7 декабря 1917 г. заменялись новыми членами.
В этот и последующие ближайшие дни в комиссию были делегированы В.В. Яковлев (К.А. Мячин), А.П. Смирнов, В.Р. Менжинский, В.В. Фомин, И.Н. Полукаров, С.Е. Щукин, С.П. Чернов и другие лица. Ключевое положение в коллегии ВЧК занимали Ф.Э. Дзержинский (председатель), Я. Х. Петерс (отвечавший в том числе за финансовые вопросы), И.К. Ксенофонтов (первоначально секретарь комиссии, позднее с 11 декабря эти функции выполнял левый эсер И.И. Ильин), Д.Г. Евсеев (с 11 декабря выполнял обязанности заместителя председателя) и В.В. Фомин. Положение остальных членов коллегии ВЧК определялось более узкими задачами, порой носившими временный характер. Так, В.Р. Менжинский должен был отвечать за борьбу с саботажем чиновников бывшего министерства финансов и банковских служащих.
10 декабря 1917 г. комиссия получила в свое распоряжение здание бывшего Петроградского градоначальства на пересечении Адмиралтейского