Кроме лечебных корпусов, к началу войны в госпитале имелись: двухэтажное каменное здание, в котором располагались лаборатория, аптека с квартирами для управляющего аптекой и его помощника, аптечный склад и ледник; двухэтажное каменное здание, в котором размещались паровая кухня, машинное отделение для электрического освещения, прачечная с сушилкой, баня, дезкамера и помещение для прачек и кастелянши; деревянное одноэтажное здание для госпитальной команды; старая деревянная кухня, где была столярная мастерская, хранились молочные продукты и жили китайцы, ходившие за коровами; небольшое деревянное здание коровника; конюшня; небольшой деревянный домик для кочегаров; одноэтажный деревянный корпус – там жили смотритель госпиталя, содержатель госпитального имущества и делопроизводитель по хозяйственной части; каменное одноэтажное здание – квартира главного доктора; каменное здание часовни с анатомическим театром при нем.
Ввиду того что штатное количество коек в госпитале было 120, а количество лечащихся больных почти всегда превышало 200, госпиталь очень часто испытывал недостаток постельного белья, больничной одежды и мебели. В начале войны было разрешено заготовить недостающее имущество на месте, что и было выполнено: одежда была изготовлена из прочной и практичной китайской дрели, туфли заказаны в Чите, а кровати – в мастерских Уссурийской железной дороги. Однако главную здесь роль сыграли многочисленные пожертвования, сделанные во время войны общественными организациями, обществами Красного Креста, а также частными лицами, в том числе и царственными особами. Кроме постельного белья и госпитальной одежды, присылались книги, предметы личной гигиены, бумага и конверты, сладости и табачные изделия.
Все пожертвования подвергались строгому учету и держались в специальном госпитальном складе, которым заведовал младший ординатор госпиталя В.К.Лемкуль. Отпуск вещей со склада происходил только по распоряжению главного доктора по мере необходимости. На большие праздники все больные госпиталя получали подарки: кисеты, табак, папиросы, печенье, почтовую бумагу.
22 февраля 1904 г. Владивосток подвергся артиллерийскому обстрелу с моря. Отряд японских крейсеров, зайдя в Уссурийский залив, который к тому времени еще не был минирован, обстрелял город с юго-востока. Вся восточная часть Владивостока, включая здания морского госпиталя, оказалась в зоне досягаемости неприятельских снарядов. Несколько крупных – 6—8-дюймовых снарядов упало на территорию госпиталя, не причинив, однако, особого вреда. Один из снарядов упал у самого дома главного доктора, но не взорвался.
Этот обстрел показал, что госпиталь лежит в сфере досягаемости неприятельских снарядов, и летом 1904 г. на случай повторных обстрелов был построен подземный госпиталь на 200 коек, сохранившийся до нашего времени. Он явился первым в мире сооружением медицинского назначения, специально возведенным в твердом грунте.
Сооружение,