III этап. Крупнейшим ученым этого периода был Александр Фридрих Вильгельм Гумбольдт (1769–1859). Его знаменитое произведение в тридцати томах «Путешествие в равноденственные области Нового Света в 1799–1804», написанное на основе наблюдений, сделанных им во время продолжительного путешествия по Южной и Центральной Америке (совместно с Э. Бонпланом), можно по праву отнести к основополагающим трудам. А. Гумбольдт обнаружил связь между климатом и характером растительности, сделал попытку установления ботанико-географических областей, развивал экологическое направление. В 1829 г. А. Гумбольдт по приглашению царя Николая I организовал экспедицию в Россию – на Урал, Алтай, Семипалатинск, Омск, Оренбург, Астрахань. Он является основоположником географии растений, геофизики, гидрографии и сравнительной климатологии.
После работ А. Гумбольдта бурными темпами стали развиваться ботанико- и зоогеографические исследования. В ботанической географии наметились четыре основных направления работ. Вопервых, появилось значительное число сводок по флоре различных районов земного шара, в том числе первая четырехтомная «Флора России» К. Ф. Ледебура (1841–1853). Во-вторых, сравнение статистических данных по флорам различных регионов земного шара привело к развитию флористического районирования. В-третьих, изучение влияния факторов современной среды на растительный покров в целом и на отдельные виды растений, а также исследование способов расселения растений составили предмет экологической ботанической географии. Наконец, в-четвертых, стали разрабатываться вопросы исторической ботанической географии. Блестящим ученым, работавшим в это время, был швейцарский ботаник Альфонс Декандоль (1806–1893), который указывал на необходимость тщательного изучения современных видовых ареалов с учетом условий окружающей среды – основного и надежного материала для флористического районирования. Он не отрицал необходимость учета исторических данных, но требовал осторожности в их использовании. А. Декандоль является одним из основоположников географии растений и учения о происхождении культурных растений.
Важным результатом биогеографических исследований данного периода явился труд Л. Шмарды «Географическое распространение животных» (1853) – сводка всех известных тогда сведений по распределению фауны и развитию экологического направления в биогеографии. Экологический подход к изучению животного мира развивал и профессор Московского университета Карл Францевич Рулье (1814–1858), которого с полным правом можно назвать одним из основателей экологии. Учение о зональном распределении животных разработано Н. А. Северцовым (1827–1855) [Наумов].
К концу этого периода большинство ученых отказываются от теории катастроф,