Членами Совета командующих по должности являются командующие (начальники) Пограничными войсками (или другие полномочные представители) государств-участников Содружества, а также Председатель Координационной службы Совета командующих. Исходя из общих принципов СНГ, члены Совета командующих обладают равными правами.
Целями деятельности Совета командующих являются: содействие реализации решений Совета глав государств и правительств Содружества, собственных решений, а также положений Устава СНГ, касающихся пограничных вопросов; координация усилий Пограничных войск в области охраны внешних границ и экономических зон, а также по обеспечению стабильного положения на них; развитие дружественных связей между Пограничными войсками государств-участников Содружества; содействие развитию и укреплению Пограничных войск государств-участников Содружества путем сближения национального законодательства по вопросам границ и их охраны, взаимного обмена информацией, сотрудничества в области военно-технической политики и подготовки кадров.
В числе приоритетных функций Совета командующих: разработка концептуальных вопросов пограничной охраны, подготовка на их основе предложений, проектов документов и договоров по пограничным вопросам; внесение в Совет глав государств и правительств, высшие органы государственной власти и управления государств Содружества предложений по вопросам охраны внешних границ и экономических зон, обеспечения деятельности Пограничных войск; координация деятельности Пограничных войск государств Содружества по вопросам, требующим совместных действий.
Совет командующих возглавляется Председателем Совета командующих Пограничными войсками и его заместителем, которые уполномочены присутствовать на заседаниях Совета глав государств и правительств и других уставных органов Содружества и представлять Совет командующих в отношениях с участниками Содружества и другими государствами, а также международными организациями по соответствующим вопросам.
Для обеспечения выполнения возложенных на Совет командующих функций создается его постоянный рабочий орган – Координационная служба. При необходимости в пределах выделенной численности и ассигнований Совет командующих может создавать временные рабочие органы. Правоспособность Координационной службы определяется Советом глав правительств СНГ, временных рабочих органов – Советом командующих в пределах предоставленных полномочий.
Неприкосновенность членов Совета командующих, военнослужащих и служащих органов Совета в силу международного характера их деятельности гарантируется. Принимающее государство обеспечивает безопасность членов Совета командующих, военнослужащих и служащих его органов и принимает необходимые меры для предупреждения или пресечения каких бы то ни было посягательств на их личность, свободу и достоинство. Члены Совета командующих,