Лесные пожары нарушают водный режим. Особенно большой вред приносят лесные пожары в горных лесах. Огонь, уничтожая лесную подстилку, оголяет каменистые и песчаные склоны, что создает благоприятные условия для развития водной и ветровой эрозии почв. Для защиты от пожаров лесничества проводят комплекс профилактических противопожарных мероприятий. Основными из них являются устройство и уход за противопожарными барьерами, строительство и ремонт дорог противопожарного назначения, профилактические контролируемые выжигания. Они способствуют снижению горимости, уменьшению количества и площади пожаров. Большое значение для оперативности в тушении лесных пожаров имеет создание Единого пункта диспетчерского управления охраны о пожаров, являющегося составной частью интегрированной системы противопожарного мониторинга, объединяющей наземные, авиационные и космические средства обнаружения.
Вторым по важности антропогенным фактором, вызывающим нарушения лесных экосистем, являются рубки леса, преимущественно сплошные. Они усугубляются большими масштабами нелегальных, так называемых браконьерских рубок самых ценных древостоев, что приводит к истощению лесных ресурсов, развитию почвенной эрозии, захламлению древесными отходами и т. д. В результате концентрированных рубок снижается товарность древесины, ухудшается экологическая обстановка. При этом не учитывается распространение на значительных площадях разновозрастных лесов, природе которых наиболее подходят выборочные рубки. В течение многих лет применяется тяжелая техника. Основным недостатком тяжелых трелевочных тракторов является то, что их трудно использовать для равномерного изреживания древостоев. Такие тракторы существенно нарушают поверхность лесной почвы, вызывая развитие эрозионных процессов.
В результате длительного антропогенного воздействия в лесах бассейна р. Селенги развивается нежелательная тенденция – уменьшение площади наиболее ценных и востребованных с экономической точки зрения сосновых насаждений. Об этом свидетельствуют структурные сдвиги в породном составе за период с 1988 по 2007 г. Особенно такие негативные тенденции характерны для Прибайкальского (снижение